{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005382576055441871],
[199.2433178660929, 474.8474925182346, 1, 0, 0.2955734076132797, 0.005018988896139937, 0, -0.03333111010325437, 1, 0.2955734076132797, 0.001264972673797221],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001257852642938952],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001272480103317315],
[199.4107639638257, 474.6800464205018, 1, 0, 0.2958218104918731, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2958218104918731, 0.001261739913274545],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.001257852642938952],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257835936967902],
[199.4107639638257, 474.6800464205018, 1, 0, 0.2958218104918731, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2958218104918731, 0.001261706397855457],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001259321867691182],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 0, 1, 0.2950273622090019, 0, 0.002104308126700796, 0.01397471230035605, 0.7049726377909982, 1, 0.001261622609308559],
[189.9771763694862, 451.2383784864701, 0, 1, 0.2962766185735514, 0, 0.002216123556143804, 0.01471727867520376, 0.7037233814264486, 1, 0.0006504885376599348],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005974761715482252],
[190.072060735807, 451.1434941201493, 1, 0, 0.2964245943448848, 0.005261162509254646, 0, -0.03493938530167878, 1, 0.2964245943448848, 0.0006511651414024801],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005946398942155601],
[189.9416460826772, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004493384770107318],
[190.0526668094112, 451.1628880465451, 1, 0, 0.2963943487804269, 0.00526169938463858, 0, -0.03494295069162164, 1, 0.2963943487804268, 0.0006011222227437777],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003432104677608573],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 0, 1, 0.2972295285928214, 0, 0.002219128472295676, 0.01473723432626849, 0.7027704714071785, 1, 0.001398694884970956],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393942002685294],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.0009082025952065268],
[199.1132320704326, 474.9152060780805, 0, 1, 0.2954077614549561, 0, 0.002105639042931783, 0.01398355091633055, 0.7045922385450439, 1, 0.001395280571857962],
[189.8337891039095, 451.3817657520469, 1, 0, 0.2960530006895326, 0.005267766105920317, 0, -0.03498323979350884, 1, 0.2960530006895326, 0.001204607479875645],
[199.2081164367534, 474.8826939475741, 1, 0, 0.2955211870091753, 0.005019875785620865, 0, -0.03333699993715319, 1, 0.2955211870091753, 0.001394356047158196],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 1, 0, 0.2950273622090019, 0.005028278189852691, 0, -0.03339280031176618, 1, 0.2950273622090018, 0.001394452881330747],
[189.0526668094112, 452.1628880465451, 1, 0, 0.2948348108178385, 0.005289531308268322, 0, -0.03512778252330825, 1, 0.2948348108178385, 0.001225107258093578],
[189.1636875361453, 452.051867319811, 0, 0, 0.2950079518558145, 0, 0, 0, 1, 1, 1.089847693395821e-05],
[198.7997432370916, 475.2910671472359, 0, 1, 0.2949153736775428, 0, 0.002103973899619324, 0.01397249269798542, 0.7050846263224572, 1, 0.001383891052302262],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001394867078284942],
[190.4729691467508, 451.0464140983864, 1, 0, 0.296909141206677, 0.005250088789394285, 0, -0.03486584471739851, 1, 0.296909141206677, 0.001393346110867407],
[199.3988736790273, 474.8438508998906, 0, 1, 0.2957375236099983, 0, 0.002105955459052213, 0.0139856522360917, 0.7042624763900017, 1, 0.001394418839861219],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 1, 0, 0.2972295285928214, 0.005246914631839138, 0, -0.0348447651340113, 1, 0.2972295285928215, 0.001194526584003667],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394213459601274],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001394185532862177],
[190.3501987028043, 450.865356153152, 0, 1, 0.2968583610632542, 0, 0.002217957060467328, 0.01472945497918586, 0.7031416389367457, 1, 0.001393463717478283],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.000704851736332177],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006882460159880394],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005941850065609499],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394555647215637],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.0009249042763794961],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394366915754804],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001136654450808726],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 2.314592293046264e-05],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001371541318323986],
[199.4238821679362, 474.6669282163912, 0, 1, 0.2958412710807262, 0, 0.002106740412182498, 0.0139908651105875, 0.7041587289192738, 1, 0.001393997779580214],
[198.9030809017628, 475.1253572467503, 1, 0, 0.2950959776239251, 0.005027574210848423, 0, -0.0333881251865194, 1, 0.295095977623925, 0.001394346395185721],
[189.3146684159952, 451.9008864399611, 0, 0, 0.2952434122695654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002076122897033607],
[189.7391779760702, 451.4763768798861, 1, 0, 0.295905451043984, 0.005270392813265583, 0, -0.03500068375952387, 1, 0.295905451043984, 0.0006080347432475073],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005782949636003494],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001146511905263743],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.001331155899427616],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0009482884757727078],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 1, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0.002217039929226069, -0.02019918610553075, 0.9120477239828115, 0.505182703619617, 0.002792683461335468],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 1, 0.2965674898184028, 0, 0.002217039929226069, 0.0147233643097275, 0.7034325101815972, 1, 0.001394745262480446],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394300818539643],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001241423955707257],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001398175609355515],
[190.0720607358071, 451.1434941201493, 1, 0, 0.2964245943448848, 0.005261162509254645, 0, -0.03493938530167877, 1, 0.2964245943448848, 0.0006497801188348728],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005957000710040128],
[190.0395486053007, 451.1760062506556, 0, 1, 0.2963738904431155, 0, 0.002216429921241068, 0.01471931324611037, 0.7036261095568845, 1, 0.000646041383784756],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005959620248865281],
[190.0881970962203, 451.127357759736, 0, 1, 0.2964497596115273, 0, 0.00221666893572122, 0.01472090054150374, 0.7035502403884728, 1, 0.0006503684509850449],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005962468466221618],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.0012637681931338],
[199.0880685904576, 474.8413941071859, 1, 2, 0.2954138075423153, 0.005022902713758763, 0.004211932710206264, -0.005385652576285612, 0.7897531697789208, 0.6502140309864342, 0.004180780492860422],
[190.3857289896134, 451.051867319811, 0, 0, 0.2968109915680291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002352108827088946],
[199.4107639638257, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2957730975533003, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2957730975533003, 0.001159367472361357],
[199.0289594746876, 475.0618509096398, 0, 1, 0.2952554113016507, 0, 0.002104989062129948, 0.01397923439319824, 0.7047445886983493, 1, 0.001237411681555183],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004974673093038657],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.000897145014213363],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003669221108376704],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.00102776615656794],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000368447745898991],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001026272756232307],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004197728696309563],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.0009740554565362117],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394172349343182],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001394547610181337],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004982524241359722],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.0008953571621969909],
[199.2997432370916, 474.7585550167295, 1, 0, 0.295671374053827, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.295671374053827, 0.001394844440830731],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0008761626705466587],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.00080806891221093],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394500920467544],
[190.0881970962203, 451.127357759736, 0, 1, 0.2964497596115273, 0, 0.00221666893572122, 0.01472090054150374, 0.7035502403884728, 1, 0.000606925119831283],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003215129693789201],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 1, 0.2965674898184028, 0, 0.002217039929226069, 0.0147233643097275, 0.7034325101815972, 1, 0.0006082212696374709],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003227589846841748],
[199.4238821679362, 474.6669282163913, 0, 1, 0.2958412710807262, 0, 0.002106740412182497, 0.0139908651105875, 0.7041587289192738, 1, 0.001096673646781824],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006207951607805734],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394349531829041],
[189.9416460826772, 451.051867319811, 0, 0, 0.2963238193697763, 0, 0, 0, 1, 1, 8.690759397389134e-06],
[199.1887225103575, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2955410912418498, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2955410912418498, 0.001386099057428224],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 2.051663987366308e-06],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001392739073149374],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004925244515432796],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.0009016503456084553],
[199.675604306247, 474.4152060780805, 0, 1, 0.2962146957505674, 0, 0.002107858237232424, 0.01399828858782292, 0.7037853042494326, 1, 0.001394483794374343],
[198.9595062727615, 474.9447929449069, 1, 0, 0.2952340658810642, 0.005026148379304179, 0, -0.03337865623785796, 1, 0.2952340658810642, 0.001394748614084858],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0009078552919217663],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.001394316780277334],
[199.2242527971666, 474.8665575871609, 0, 1, 0.2955451249714864, 0, 0.00210585475861069, 0.01398498348436236, 0.7044548750285136, 1, 0.001266796519141804],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001259876361766162],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001261768175914158],
[189.9493291447401, 451.3285979470306, 0, 1, 0.2962043774158426, 0, 0.002215680558574671, 0.0147143367279196, 0.7037956225841574, 1, 0.0005969161693468372],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005759708061437588],
[199.3840158328365, 474.5202833848319, 0, 1, 0.2958639914662962, 0, 0.002107391475169057, 0.01399518882050961, 0.7041360085337038, 1, 0.00118545050837608],
[199.3427215465102, 474.7480888378172, 0, 1, 0.295720870950394, 0, 0.002106380254100651, 0.01398847330041836, 0.704279129049606, 1, 0.001115089252994339],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001396361341237678],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001393456014657114],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393721010580831],
[199.2081164367534, 474.8826939475741, 1, 0, 0.2955211870091753, 0.005019875785620865, 0, -0.03333699993715319, 1, 0.2955211870091753, 0.0009019826719471389],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394715013071616],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001394862921197439],
[199.2997432370916, 474.8534393830503, 0, 1, 0.2956297594895268, 0, 0.002105912934524055, 0.01398536983065916, 0.7043702405104733, 1, 0.001173168173831942],
[199.1887225103575, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2955410912418498, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2955410912418498, 0.001170352196141131],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 1, 0, 0.2972295285928214, 0.005246914631839138, 0, -0.0348447651340113, 1, 0.2972295285928215, 0.001194307613845513],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001395184250214333],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394675380636251],
[199.0853848456864, 475.0677977744555, 0, 1, 0.2953117925987201, 0, 0.002104962712026974, 0.01397905940213896, 0.7046882074012799, 1, 0.001395289892555481],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 9.739012239307595e-05],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001257852642938952],
[199.2433178660929, 474.8474925182346, 1, 0, 0.2955734076132797, 0.005018988896139937, 0, -0.03333111010325437, 1, 0.2955734076132797, 0.001264972673797221],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257852642938952],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257852642938952],
[190.4771763694862, 451.1047230334661, 0, 1, 0.2968867677637754, 0, 0.002216780159771932, 0.01472163918053187, 0.7031132322362246, 1, 0.0006437812505172254],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005931576257643597],
[199.2997432370916, 474.7155767073109, 0, 1, 0.2956902274172807, 0, 0.002106524515028831, 0.01398943133738164, 0.7043097725827193, 1, 0.001394392560909752],
[189.9416460826772, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 4.949800295350063e-06],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001389843066236182],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001376117161808346],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 5.57122616873645e-06],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001389219064758046],
[198.9030809017628, 475.1253572467503, 1, 0, 0.2950959776239251, 0.005027574210848423, 0, -0.0333881251865194, 1, 0.295095977623925, 0.001394726760084396],
[199.2997432370916, 474.8534393830503, 0, 1, 0.2956297594895268, 0, 0.002105912934524055, 0.01398536983065916, 0.7043702405104733, 1, 0.001259885650626918],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.001246024163556914],
[199.3840158328365, 474.5202833848319, 0, 1, 0.2958639914662962, 0, 0.002107391475169057, 0.01399518882050961, 0.7041360085337038, 1, 0.001259885650626918],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001261067772290844],
[199.362115472906, 474.7286949114215, 0, 1, 0.2957496414455514, 0, 0.002106466305321164, 0.01398904476665684, 0.7042503585544486, 1, 0.001259885650626918],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001259868895970618],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 1, 0, 0.2950273622090018, 0.005028278189852692, 0, -0.03339280031176618, 1, 0.2950273622090018, 0.001259868895970618],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393943295816104],
[199.2242527971666, 474.8665575871609, 0, 1, 0.2955451249714864, 0, 0.00210585475861069, 0.01398498348436236, 0.7044548750285136, 1, 0.001394673841670961],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394631980703187]
],
"NAMES": [
["Node760"],
["Node743"],
["Node740"],
["Node737"],
["Node734"],
["Node731"],
["Node728"],
["Node725"],
["Node722"],
["Node719"],
["Node715"],
["Node714"],
["Node710"],
["Node709"],
["Node187"],
["Node186"],
["Node185"],
["Node197"],
["Node194"],
["Node205"],
["Node208"],
["Node242"],
["Node241"],
["Node236"],
["Node227"],
["Node219"],
["Node218"],
["Node231"],
["Node250"],
["Node249"],
["Node255"],
["Node254"],
["Node287"],
["Node277"],
["Node276"],
["Node275"],
["Node283"],
["Node274"],
["Node265"],
["Node268"],
["Node302"],
["Node293"],
["Node292"],
["Node297"],
["Node110"],
["Node339"],
["Node338"],
["Node337"],
["Node334"],
["Node314"],
["Node310"],
["Node321"],
["Node320"],
["Node318"],
["Node331"],
["Node327"],
["Node581"],
["Node580"],
["Node395"],
["Node394"],
["Node390"],
["Node389"],
["Node385"],
["Node369"],
["Node375"],
["Node374"],
["Node482"],
["Node456"],
["Node455"],
["Node442"],
["Node441"],
["Node437"],
["Node436"],
["Node432"],
["Node431"],
["Node426"],
["Node423"],
["Node414"],
["Node413"],
["Node420"],
["Node448"],
["Node451"],
["Node465"],
["Node473"],
["Node472"],
["Node478"],
["Node477"],
["Node493"],
["Node487"],
["Node515"],
["Node527"],
["Node526"],
["Node534"],
["Node533"],
["Node540"],
["Node539"],
["Node544"],
["Node565"],
["Node562"],
["Node555"],
["Node586"],
["Node591"],
["Node596"],
["Node618"],
["Node617"],
["Node614"],
["Node611"],
["Node607"],
["Node625"],
["Node624"],
["Node631"],
["Node641"],
["Node644"],
["Node699"],
["Node696"],
["Node682"],
["Node686"],
["Node680"],
["Node692"],
["Node704"],
["Node747"],
["Node750"],
["Node754"],
["Node757"],
["Node767"],
["Node766"],
["Node774"],
["Node778"],
["Node777"],
["Node785"],
["Node789"],
["Node788"],
["Node795"],
["Node804"],
["Node809"],
["Node814"],
["Node819"],
["Node824"],
["Node829"],
["Node834"],
["Node13"],
["Node28"],
["Node95"]
],
"RESOLVED": [
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005382576055441871],
[199.2433178660929, 474.8474925182346, 1, 0, 0.2955734076132797, 0.005018988896139937, 0, -0.03333111010325437, 1, 0.2955734076132797, 0.001264972673797221],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001257852642938952],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001272480103317315],
[199.4107639638257, 474.6800464205018, 1, 0, 0.2958218104918731, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2958218104918731, 0.001261739913274545],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.001257852642938952],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257835936967902],
[199.4107639638257, 474.6800464205018, 1, 0, 0.2958218104918731, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2958218104918731, 0.001261706397855457],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001259321867691182],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 0, 1, 0.2950273622090019, 0, 0.002104308126700796, 0.01397471230035605, 0.7049726377909982, 1, 0.001261622609308559],
[189.9771763694862, 451.2383784864701, 0, 1, 0.2962766185735514, 0, 0.002216123556143804, 0.01471727867520376, 0.7037233814264486, 1, 0.0006504885376599348],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005974761715482252],
[190.072060735807, 451.1434941201493, 1, 0, 0.2964245943448848, 0.005261162509254646, 0, -0.03493938530167878, 1, 0.2964245943448848, 0.0006511651414024801],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005946398942155601],
[189.9416460826772, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004493384770107318],
[190.0526668094112, 451.1628880465451, 1, 0, 0.2963943487804269, 0.00526169938463858, 0, -0.03494295069162164, 1, 0.2963943487804268, 0.0006011222227437777],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003432104677608573],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 0, 1, 0.2972295285928214, 0, 0.002219128472295676, 0.01473723432626849, 0.7027704714071785, 1, 0.001398694884970956],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393942002685294],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.0009082025952065268],
[199.1132320704326, 474.9152060780805, 0, 1, 0.2954077614549561, 0, 0.002105639042931783, 0.01398355091633055, 0.7045922385450439, 1, 0.001395280571857962],
[189.8337891039095, 451.3817657520469, 1, 0, 0.2960530006895326, 0.005267766105920317, 0, -0.03498323979350884, 1, 0.2960530006895326, 0.001204607479875645],
[199.2081164367534, 474.8826939475741, 1, 0, 0.2955211870091753, 0.005019875785620865, 0, -0.03333699993715319, 1, 0.2955211870091753, 0.001394356047158196],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 1, 0, 0.2950273622090019, 0.005028278189852691, 0, -0.03339280031176618, 1, 0.2950273622090018, 0.001394452881330747],
[189.0526668094112, 452.1628880465451, 1, 0, 0.2948348108178385, 0.005289531308268322, 0, -0.03512778252330825, 1, 0.2948348108178385, 0.001225107258093578],
[189.1636875361453, 452.051867319811, 0, 0, 0.2950079518558145, 0, 0, 0, 1, 1, 1.089847693395821e-05],
[198.7997432370916, 475.2910671472359, 0, 1, 0.2949153736775428, 0, 0.002103973899619324, 0.01397249269798542, 0.7050846263224572, 1, 0.001383891052302262],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001394867078284942],
[190.4729691467508, 451.0464140983864, 1, 0, 0.296909141206677, 0.005250088789394285, 0, -0.03486584471739851, 1, 0.296909141206677, 0.001393346110867407],
[199.3988736790273, 474.8438508998906, 0, 1, 0.2957375236099983, 0, 0.002105955459052213, 0.0139856522360917, 0.7042624763900017, 1, 0.001394418839861219],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 1, 0, 0.2972295285928214, 0.005246914631839138, 0, -0.0348447651340113, 1, 0.2972295285928215, 0.001194526584003667],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394213459601274],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001394185532862177],
[190.3501987028043, 450.865356153152, 0, 1, 0.2968583610632542, 0, 0.002217957060467328, 0.01472945497918586, 0.7031416389367457, 1, 0.001393463717478283],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.000704851736332177],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006882460159880394],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005941850065609499],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394555647215637],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.0009249042763794961],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394366915754804],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001136654450808726],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 2.314592293046264e-05],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001371541318323986],
[199.4238821679362, 474.6669282163912, 0, 1, 0.2958412710807262, 0, 0.002106740412182498, 0.0139908651105875, 0.7041587289192738, 1, 0.001393997779580214],
[198.9030809017628, 475.1253572467503, 1, 0, 0.2950959776239251, 0.005027574210848423, 0, -0.0333881251865194, 1, 0.295095977623925, 0.001394346395185721],
[189.3146684159952, 451.9008864399611, 0, 0, 0.2952434122695654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002076122897033607],
[189.7391779760702, 451.4763768798861, 1, 0, 0.295905451043984, 0.005270392813265583, 0, -0.03500068375952387, 1, 0.295905451043984, 0.0006080347432475073],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005782949636003494],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001146511905263743],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.001331155899427616],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0009482884757727078],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 1, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0.002217039929226069, -0.02019918610553075, 0.9120477239828115, 0.505182703619617, 0.002792683461335468],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 1, 0.2965674898184028, 0, 0.002217039929226069, 0.0147233643097275, 0.7034325101815972, 1, 0.001394745262480446],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394300818539643],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001241423955707257],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001398175609355515],
[190.0720607358071, 451.1434941201493, 1, 0, 0.2964245943448848, 0.005261162509254645, 0, -0.03493938530167877, 1, 0.2964245943448848, 0.0006497801188348728],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005957000710040128],
[190.0395486053007, 451.1760062506556, 0, 1, 0.2963738904431155, 0, 0.002216429921241068, 0.01471931324611037, 0.7036261095568845, 1, 0.000646041383784756],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005959620248865281],
[190.0881970962203, 451.127357759736, 0, 1, 0.2964497596115273, 0, 0.00221666893572122, 0.01472090054150374, 0.7035502403884728, 1, 0.0006503684509850449],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005962468466221618],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.0012637681931338],
[199.0880685904576, 474.8413941071859, 1, 2, 0.2954138075423153, 0.005022902713758763, 0.004211932710206264, -0.005385652576285612, 0.7897531697789208, 0.6502140309864342, 0.004180780492860422],
[190.3857289896134, 451.051867319811, 0, 0, 0.2968109915680291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002352108827088946],
[199.4107639638257, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2957730975533003, 0.005014774429034363, 0, -0.03330312182313874, 1, 0.2957730975533003, 0.001159367472361357],
[199.0289594746876, 475.0618509096398, 0, 1, 0.2952554113016507, 0, 0.002104989062129948, 0.01397923439319824, 0.7047445886983493, 1, 0.001237411681555183],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004974673093038657],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.000897145014213363],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003669221108376704],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.00102776615656794],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000368447745898991],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001026272756232307],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004197728696309563],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.0009740554565362117],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394172349343182],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001394547610181337],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004982524241359722],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.0008953571621969909],
[199.2997432370916, 474.7585550167295, 1, 0, 0.295671374053827, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.295671374053827, 0.001394844440830731],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0008761626705466587],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.00080806891221093],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394500920467544],
[190.0881970962203, 451.127357759736, 0, 1, 0.2964497596115273, 0, 0.00221666893572122, 0.01472090054150374, 0.7035502403884728, 1, 0.000606925119831283],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003215129693789201],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 1, 0.2965674898184028, 0, 0.002217039929226069, 0.0147233643097275, 0.7034325101815972, 1, 0.0006082212696374709],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003227589846841748],
[199.4238821679362, 474.6669282163913, 0, 1, 0.2958412710807262, 0, 0.002106740412182497, 0.0139908651105875, 0.7041587289192738, 1, 0.001096673646781824],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006207951607805734],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394349531829041],
[189.9416460826772, 451.051867319811, 0, 0, 0.2963238193697763, 0, 0, 0, 1, 1, 8.690759397389134e-06],
[199.1887225103575, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2955410912418498, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2955410912418498, 0.001386099057428224],
[189.9416460826771, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 2.051663987366308e-06],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140178, 0.005020364543720599, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001392739073149374],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004925244515432796],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.0009016503456084553],
[199.675604306247, 474.4152060780805, 0, 1, 0.2962146957505674, 0, 0.002107858237232424, 0.01399828858782292, 0.7037853042494326, 1, 0.001394483794374343],
[198.9595062727615, 474.9447929449069, 1, 0, 0.2952340658810642, 0.005026148379304179, 0, -0.03337865623785796, 1, 0.2952340658810642, 0.001394748614084858],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.0009078552919217663],
[199.2997432370916, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2957389401855093, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7042610598144907, 1, 0.001394316780277334],
[199.2242527971666, 474.8665575871609, 0, 1, 0.2955451249714864, 0, 0.00210585475861069, 0.01398498348436236, 0.7044548750285136, 1, 0.001266796519141804],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001259876361766162],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001261768175914158],
[189.9493291447401, 451.3285979470306, 0, 1, 0.2962043774158426, 0, 0.002215680558574671, 0.0147143367279196, 0.7037956225841574, 1, 0.0005969161693468372],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005759708061437588],
[199.3840158328365, 474.5202833848319, 0, 1, 0.2958639914662962, 0, 0.002107391475169057, 0.01399518882050961, 0.7041360085337038, 1, 0.00118545050837608],
[199.3427215465102, 474.7480888378172, 0, 1, 0.295720870950394, 0, 0.002106380254100651, 0.01398847330041836, 0.704279129049606, 1, 0.001115089252994339],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001396361341237678],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001393456014657114],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393721010580831],
[199.2081164367534, 474.8826939475741, 1, 0, 0.2955211870091753, 0.005019875785620865, 0, -0.03333699993715319, 1, 0.2955211870091753, 0.0009019826719471389],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394715013071616],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001394862921197439],
[199.2997432370916, 474.8534393830503, 0, 1, 0.2956297594895268, 0, 0.002105912934524055, 0.01398536983065916, 0.7043702405104733, 1, 0.001173168173831942],
[199.1887225103575, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2955410912418498, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2955410912418498, 0.001170352196141131],
[190.5881970962203, 450.627357759736, 1, 0, 0.2972295285928214, 0.005246914631839138, 0, -0.0348447651340113, 1, 0.2972295285928215, 0.001194307613845513],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 1, 0, 0.2965674898184028, 0.00525862751693814, 0, -0.03492255041525825, 1, 0.2965674898184028, 0.001395184250214333],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001394675380636251],
[199.0853848456864, 475.0677977744555, 0, 1, 0.2953117925987201, 0, 0.002104962712026974, 0.01397905940213896, 0.7046882074012799, 1, 0.001395289892555481],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 9.739012239307595e-05],
[199.1132320704326, 474.9775783138949, 0, 1, 0.2953804279825588, 0, 0.002105362538479948, 0.01398171464999904, 0.7046195720174412, 1, 0.001257852642938952],
[199.2433178660929, 474.8474925182346, 1, 0, 0.2955734076132797, 0.005018988896139937, 0, -0.03333111010325437, 1, 0.2955734076132797, 0.001264972673797221],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257852642938952],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001257852642938952],
[190.4771763694862, 451.1047230334661, 0, 1, 0.2968867677637754, 0, 0.002216780159771932, 0.01472163918053187, 0.7031132322362246, 1, 0.0006437812505172254],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 0, 0.2956571135029455, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005931576257643597],
[199.2997432370916, 474.7155767073109, 0, 1, 0.2956902274172807, 0, 0.002106524515028831, 0.01398943133738164, 0.7043097725827193, 1, 0.001394392560909752],
[189.9416460826772, 451.2739087732792, 0, 0, 0.2962212077424509, 0, 0, 0, 1, 1, 4.949800295350063e-06],
[199.1887225103575, 474.9020878739699, 1, 0, 0.2954924165140179, 0.005020364543720598, 0, -0.03334024578016524, 1, 0.2954924165140178, 0.001389843066236182],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001376117161808346],
[190.1636875361453, 451.051867319811, 0, 0, 0.2965674898184028, 0, 0, 0, 1, 1, 5.57122616873645e-06],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001389219064758046],
[198.9030809017628, 475.1253572467503, 1, 0, 0.2950959776239251, 0.005027574210848423, 0, -0.0333881251865194, 1, 0.295095977623925, 0.001394726760084396],
[199.2997432370916, 474.8534393830503, 0, 1, 0.2956297594895268, 0, 0.002105912934524055, 0.01398536983065916, 0.7043702405104733, 1, 0.001259885650626918],
[199.4862544037506, 474.6045559805768, 0, 1, 0.2959337990233321, 0, 0.002107017278698279, 0.01399270378138602, 0.7040662009766678, 1, 0.001246024163556914],
[199.3840158328365, 474.5202833848319, 0, 1, 0.2958639914662962, 0, 0.002107391475169057, 0.01399518882050961, 0.7041360085337038, 1, 0.001259885650626918],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001261067772290844],
[199.362115472906, 474.7286949114215, 0, 1, 0.2957496414455514, 0, 0.002106466305321164, 0.01398904476665684, 0.7042503585544486, 1, 0.001259885650626918],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001259868895970618],
[198.8752336770166, 475.2155767073109, 1, 0, 0.2950273622090018, 0.005028278189852692, 0, -0.03339280031176618, 1, 0.2950273622090018, 0.001259868895970618],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 1, 0, 0.2956571135029455, 0.005017567929379501, 0, -0.0333216734616269, 1, 0.2956571135029455, 0.001393943295816104],
[199.2242527971666, 474.8665575871609, 0, 1, 0.2955451249714864, 0, 0.00210585475861069, 0.01398498348436236, 0.7044548750285136, 1, 0.001394673841670961],
[199.2997432370916, 474.7910671472359, 0, 1, 0.2956571135029455, 0, 0.00210618958357507, 0.01398720705727396, 0.7043428864970545, 1, 0.001394631980703187]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.6298492455887741, 2.368585424793072, 0, 3, 0.2100593525716416, 0, 1.266578764100134, 8.411350794805257, 0.492927882528771, 1, 0.1505797100844203],
[0.9996957289645998, 2.000304271035399, 1, 2, 0.3332319096548668, 1.000304363644442, 0.9998478876239957, -0.003031457692340715, 0.7408759620231804, 0.7035684515578465, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9994673991162586, 2.00053260088374, 0, 1, 0.3331557997054196, 0, 0.4998668852275877, 3.319616467234162, 0.6668442002945804, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.09258378681065, 0, 0, 0.1700379510384484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.267454828008645, 0, 0, 0.159009456627355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9993008052558965, 2.000699194744102, 0, 1, 0.3331002684186323, 0, 0.4998252624017796, 3.319340050007799, 0.6668997315813676, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.609413355042015, 0, 0, 0.2517770054960737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003943156418386, 1.996056843581612, 0, 1, 0.3346477188061289, 0, 0.5009877365043653, 3.327060041645013, 0.665352281193871, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917195429927, 2.151908280457006, 1, 0, 0.2826972398476643, 1.17911774983355, 0, -7.830522114649412, 1, 0.2826972398476644, 0.1505797100844203],
[0.99919429134251, 2.000805708657489, 0, 1, 0.3330647637808368, 0, 0.4997986539487561, 3.319163343245589, 0.6669352362191632, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.001340275081139958, 2.142792411155231, 0, 1, 0.0006250896177011149, 0, 0.4666807642187215, 3.09922740558528, 0.9993749103822989, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248763804462998, 0, 1, 0.2180229596342322, 0, 0.4446887654520918, 2.9531785205509, 0.7819770403657678, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845867666118207, 1.152404769184906, 1, 0, 0.6156437435051153, 0.5417506457020094, 0, -3.597766560968173, 1, 0.6156437435051153, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.609413355042015, 0, 0, 0.2517770054960737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917195429927, 2.151908280457006, 1, 0, 0.2826972398476643, 1.17911774983355, 0, -7.830522114649412, 1, 0.2826972398476644, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.053708178588102, 1.822125298499787, 0, 1, 0.366400971051739, 0, 0.5488096789081032, 3.644645607302744, 0.6335990289482609, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.267454828008645, 0, 0, 0.159009456627355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7528713595030319, 2.24712864049697, 0, 1, 0.2509571198343438, 0, 0.4450123513083979, 2.955327454534932, 0.7490428801656561, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479133350846808, 2.152086664915318, 1, 0, 0.2826377783615603, 1.179365813252755, 0, -7.832169504055762, 1, 0.2826377783615603, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845467337572701, 1.154532662427297, 1, 0, 0.6151557791909007, 0.541868165120319, 0, -3.598547007538589, 1, 0.6151557791909007, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.000705100534863, 1.997734378845036, 1, 1, 0.3337419705872525, 0.9992953962815959, 0.5005670476463128, -3.312055444625829, 0.8886162970685376, 0.5561002382430424, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2180598073789629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9984419975055853, 2.001558002494413, 0, 1, 0.3328139991685286, 0, 0.4996108025616866, 3.317915822002759, 0.6671860008314714, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.320500482566227, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479843497056028, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2977489499874743, 1.179267047024126, 0, -7.831513597436117, 1, 0.2977489499874744, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9345795091208924, 2.065420490879106, 1, 0, 0.3115265030402976, 1.069999920007496, 0, -7.105870501461429, 1, 0.3115265030402976, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9971468577497735, 2.002275197394265, 0, 2, 0.3324463311322449, 0, 0.9988636939631343, 6.633454755644941, 0.4456279008188005, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.9345803518983569, 2.065419648101642, 1, 0, 0.311526783966119, 1.069998955112592, 0, -7.105864093593436, 1, 0.3115267839661191, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9985921161118603, 2.001407883888138, 0, 2, 0.3328640387039536, 0, 0.9992965532416096, 6.636329374531061, 0.4450703908543999, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248799724062716, 0, 1, 0.2180202364410308, 0, 0.4446816625330177, 2.953131350058474, 0.7819797635589693, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982726842707379, 2.001727315729261, 0, 1, 0.3327575614235794, 0, 0.4995685436983129, 3.317635180850309, 0.6672424385764206, 1, 0.1505797100844203],
[1.000663442580756, 1.997868233717398, 0, 1, 0.3337178161199644, 0, 0.5005335102302105, 3.324043524519962, 0.6662821838800356, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.054844706922173, 1.820658072529865, 0, 1, 0.3668383541340851, 0, 0.5492519518563234, 3.647582742378726, 0.6331616458659148, 1, 0.1505797100844203],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003367571596392, 1.996632428403607, 2, 0, 0.3344558571987974, 1.993287461760331, 0, -13.23742395733677, 1, 0.1118607204145824, 0.1505797100844203],
[0.8493373878032304, 2.150662612196768, 0, 1, 0.283112462601077, 0, 0.4649729782481141, 3.087885997306236, 0.716887537398923, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2980040092203164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982704377456573, 2.001729562254341, 0, 1, 0.3327568125818859, 0, 0.4995679830365313, 3.317631457494876, 0.6672431874181142, 1, 0.1505797100844203],
[0.8476819723852564, 2.152318027614742, 1, 0, 0.2825606574617523, 1.179687704323996, 0, -7.834307182970542, 1, 0.2825606574617523, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.846134379804498, 1.1538656201955, 1, 0, 0.6153781266014998, 0.5416723782078626, 0, -3.597246786464006, 1, 0.6153781266014998, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.003480762245986106, 2.996519237754014, 0, 1, 0.001160254081995368, 0, 0.3337205339450887, 2.216238388013851, 0.9988397459180046, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479912028365351, 2.152008797163464, 1, 0, 0.2826637342788452, 1.179257516652289, 0, -7.83145030622755, 1, 0.2826637342788452, 0.1505797100844203],
[0.6279079333296762, 2.372092066670322, 1, 0, 0.2093026444432255, 1.592590166359565, 0, -10.57639283185432, 1, 0.2093026444432255, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8468158982273564, 2.153184101772642, 2, 0, 0.2822719660757856, 2.361788440895606, 0, -15.68463931542639, 1, 0.07967746283228938, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003366954282642, 1.996633045717356, 2, 0, 0.3344556514275475, 1.993288688115009, 0, -13.23743210155937, 1, 0.1118605827718252, 0.1505797100844203],
[0.8479892439574461, 2.152010756042552, 1, 0, 0.2826630813191489, 1.179260240770438, 0, -7.831468397098809, 1, 0.2826630813191489, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.37129530349955, 0, 2, 0.2091129369865107, 0, 0.8434208919692145, 5.601158957580427, 0.625502346442103, 1, 0.1505797100844203],
[0.9996739494288391, 2.00032605057116, 0, 1, 0.3332246498096132, 0, 0.4999185006436659, 3.319959245262154, 0.6667753501903868, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845345082170498, 1.154077202370174, 1, 0, 0.6152335040256234, 0.5419040642652042, 0, -3.598785413794419, 1, 0.6152335040256234, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5410935130544047, 1.980207056566689, 1, 0, 0.2146088885926526, 1.848109385668156, 0, -12.27329621389256, 1, 0.2146088885926526, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9349757389872206, 2.065024261012778, 0, 0, 0.311658579662407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -19.92300289539736, 1, 0.03703703703703698, 0.1505797100844203],
[0.9349757389872206, 2.065024261012778, 0, 0, 0.311658579662407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982722937199429, 2.001727706280056, 0, 1, 0.3327574312399811, 0, 0.4995684462290662, 3.317634533556948, 0.6672425687600189, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7526262434781757, 2.247373756521826, 0, 1, 0.2508754144927252, 0, 0.4449638148074051, 2.955005123584995, 0.7491245855072748, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.371464330823669, 0, 1, 0.2091011489311783, 0, 0.4216803883584768, 2.800379866066072, 0.7908988510688216, 1, 0.1505797100844203],
[1.84546239355948, 1.154537606440519, 0, 1, 0.6151541311864934, 0, 0.8661476199835846, 5.752087180258161, 0.3848458688135066, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9993649142605475, 2.000635085739451, 0, 1, 0.3331216380868493, 0, 0.4998412789658699, 3.319446416025381, 0.6668783619131506, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2180598073789629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917318601173, 2.151908268139882, 1, 0, 0.2826972439533725, 1.179117732708822, 0, -7.830522000924076, 1, 0.2826972439533726, 0.1505797100844203],
[0.9314881608672372, 2.068511839132761, 2, 0, 0.3104960536224125, 2.14710189997257, 0, -14.25890578995556, 0.9999999999999999, 0.09640779931509214, 0.1505797100844203],
[0.432496612674772, 2.267893163520379, 1, 1, 0.1601608095569669, 2.312156837057076, 0.4409378784173994, -12.42676691030023, 0.974348515082057, 0.2946701341959908, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.84141488664523, 1.158007555447939, 2, 0, 0.6139231542723889, 1.086121337730514, 0, -7.212932852119295, 1, 0.3769016393517594, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5410935130544046, 2.155078097764683, 1, 0, 0.2006895669708585, 1.848109385668156, 0, -12.27329621389257, 1, 0.2006895669708585, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9344268882413618, 2.065573111758637, 1, 0, 0.3114756294137874, 1.070174684166088, 0, -7.107031110407308, 1, 0.3114756294137874, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.085956618837165, 1.065024261012779, 0, 0, 0.5048657703144823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9871964738137837, 2.012803526186215, 1, 2, 0.3290654912712614, 1.012969582576357, 0.9936389587857715, -0.1283746912498905, 0.7464128268746242, 0.6979767409327013, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6281792919573266, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2390169094930706, 1.591902204996487, 0, -10.57182407977815, 1, 0.2390169094930706, 0.1505797100844203],
[0.8459366777122732, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2972436752852442, 1.182121577591802, 0, -7.850470537691051, 1, 0.2972436752852442, 0.1505797100844203],
[2.550473554583235, 9.653183880684717, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.057919820817166, 9.145737614450786, 0, 0, 0.2505740461035831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[2.550473554583235, 9.145737614450786, 0, 0, 0.218059807378963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[2.372882685980577, 9.830774749287373, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[3.553691439694812, 7.138422333533136, 0, 2, 0.3323656589394814, 0, 0.2801739525279821, 8.266349525649652, 0.4457356133633129, 1, 0.03389331066374951],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.055694449492359, 1.819561078878806, 0, 0, 0.3671654359327188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.913742215989445, 1, 0, 0.3432012600539616, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3432012600539616, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 1.7222640970395, 0, 0, 0.1993122239377376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480906363001066, 2.151909363699892, 1, 1, 0.2826968787667023, 1.17911925588828, 0.4647035869023065, -4.744435147241599, 0.9200824747355643, 0.4854762322689691, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8481562326383334, 1.999999999999999, 1, 0, 0.297791330025692, 1.179028062895124, 0, -7.82992650360476, 1, 0.297791330025692, 0.1505797100844203],
[0.6286264641172938, 2.371373535882704, 0, 1, 0.2095421547057647, 0, 0.4216965336200257, 2.8004870867636, 0.7904578452942352, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2980040092203164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.8479871056241617, 2.152012894375837, 1, 0, 0.2826623685413874, 1.179263214461202, 0, -7.831488145382042, 1, 0.2826623685413874, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9977747932268808, 2.002225206773118, 0, 1, 0.3325915977422937, 0, 0.4994443165619955, 3.31681018831813, 0.6674084022577063, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150281826120912, 0, 1, 0.2830723343069793, 0, 0.4650553187272157, 3.088432820507419, 0.7169276656930207, 1, 0.1505797100844203],
[0.6285210181752872, 2.371478981824711, 0, 1, 0.2095070060584292, 0, 0.4216777832163454, 2.800362565314662, 0.7904929939415708, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6279079086191348, 2.372092091380864, 1, 0, 0.2093026362063784, 1.592590229033988, 0, -10.57639324807522, 1, 0.2093026362063783, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6274995290553784, 2.37250047094462, 0, 1, 0.2091665096851263, 0, 0.4214962282396708, 2.799156858539342, 0.7908334903148737, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479907003407599, 2.152009299659239, 1, 0, 0.2826635667802534, 1.179258215447594, 0, -7.831454946927844, 1, 0.2826635667802534, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[1.055694449492359, 1.819561078878806, 0, 0, 0.3671654359327188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 1.7222640970395, 0, 0, 0.1993122239377376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.6298492455887741, 2.368585424793072, 0, 3, 0.2100593525716416, 0, 1.266578764100134, 8.411350794805257, 0.492927882528771, 1, 0.1505797100844203],
[0.9996957289645998, 2.000304271035399, 1, 2, 0.3332319096548668, 1.000304363644442, 0.9998478876239957, -0.003031457692340715, 0.7408759620231804, 0.7035684515578465, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9994673991162586, 2.00053260088374, 0, 1, 0.3331557997054196, 0, 0.4998668852275877, 3.319616467234162, 0.6668442002945804, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.09258378681065, 0, 0, 0.1700379510384484, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.267454828008645, 0, 0, 0.159009456627355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9993008052558965, 2.000699194744102, 0, 1, 0.3331002684186323, 0, 0.4998252624017796, 3.319340050007799, 0.6668997315813676, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.609413355042015, 0, 0, 0.2517770054960737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003943156418386, 1.996056843581612, 0, 1, 0.3346477188061289, 0, 0.5009877365043653, 3.327060041645013, 0.665352281193871, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917195429927, 2.151908280457006, 1, 0, 0.2826972398476643, 1.17911774983355, 0, -7.830522114649412, 1, 0.2826972398476644, 0.1505797100844203],
[0.99919429134251, 2.000805708657489, 0, 1, 0.3330647637808368, 0, 0.4997986539487561, 3.319163343245589, 0.6669352362191632, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.001340275081139958, 2.142792411155231, 0, 1, 0.0006250896177011149, 0, 0.4666807642187215, 3.09922740558528, 0.9993749103822989, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248763804462998, 0, 1, 0.2180229596342322, 0, 0.4446887654520918, 2.9531785205509, 0.7819770403657678, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845867666118207, 1.152404769184906, 1, 0, 0.6156437435051153, 0.5417506457020094, 0, -3.597766560968173, 1, 0.6156437435051153, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.609413355042015, 0, 0, 0.2517770054960737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917195429927, 2.151908280457006, 1, 0, 0.2826972398476643, 1.17911774983355, 0, -7.830522114649412, 1, 0.2826972398476644, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.053708178588102, 1.822125298499787, 0, 1, 0.366400971051739, 0, 0.5488096789081032, 3.644645607302744, 0.6335990289482609, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 2.267454828008645, 0, 0, 0.159009456627355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7528713595030319, 2.24712864049697, 0, 1, 0.2509571198343438, 0, 0.4450123513083979, 2.955327454534932, 0.7490428801656561, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479133350846808, 2.152086664915318, 1, 0, 0.2826377783615603, 1.179365813252755, 0, -7.832169504055762, 1, 0.2826377783615603, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845467337572701, 1.154532662427297, 1, 0, 0.6151557791909007, 0.541868165120319, 0, -3.598547007538589, 1, 0.6151557791909007, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.000705100534863, 1.997734378845036, 1, 1, 0.3337419705872525, 0.9992953962815959, 0.5005670476463128, -3.312055444625829, 0.8886162970685376, 0.5561002382430424, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 6.641000965132454, 0.4444444444444445, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2180598073789629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9984419975055853, 2.001558002494413, 0, 1, 0.3328139991685286, 0, 0.4996108025616866, 3.317915822002759, 0.6671860008314714, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -3.320500482566227, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479843497056028, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2977489499874743, 1.179267047024126, 0, -7.831513597436117, 1, 0.2977489499874744, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4584324751920707, 2.541567524807928, 0, 0, 0.1528108250640236, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9345795091208924, 2.065420490879106, 1, 0, 0.3115265030402976, 1.069999920007496, 0, -7.105870501461429, 1, 0.3115265030402976, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9971468577497735, 2.002275197394265, 0, 2, 0.3324463311322449, 0, 0.9988636939631343, 6.633454755644941, 0.4456279008188005, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.9345803518983569, 2.065419648101642, 1, 0, 0.311526783966119, 1.069998955112592, 0, -7.105864093593436, 1, 0.3115267839661191, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9985921161118603, 2.001407883888138, 0, 2, 0.3328640387039536, 0, 0.9992965532416096, 6.636329374531061, 0.4450703908543999, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248799724062716, 0, 1, 0.2180202364410308, 0, 0.4446816625330177, 2.953131350058474, 0.7819797635589693, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982726842707379, 2.001727315729261, 0, 1, 0.3327575614235794, 0, 0.4995685436983129, 3.317635180850309, 0.6672424385764206, 1, 0.1505797100844203],
[1.000663442580756, 1.997868233717398, 0, 1, 0.3337178161199644, 0, 0.5005335102302105, 3.324043524519962, 0.6662821838800356, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.054844706922173, 1.820658072529865, 0, 1, 0.3668383541340851, 0, 0.5492519518563234, 3.647582742378726, 0.6331616458659148, 1, 0.1505797100844203],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003367571596392, 1.996632428403607, 2, 0, 0.3344558571987974, 1.993287461760331, 0, -13.23742395733677, 1, 0.1118607204145824, 0.1505797100844203],
[0.8493373878032304, 2.150662612196768, 0, 1, 0.283112462601077, 0, 0.4649729782481141, 3.087885997306236, 0.716887537398923, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2980040092203164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982704377456573, 2.001729562254341, 0, 1, 0.3327568125818859, 0, 0.4995679830365313, 3.317631457494876, 0.6672431874181142, 1, 0.1505797100844203],
[0.8476819723852564, 2.152318027614742, 1, 0, 0.2825606574617523, 1.179687704323996, 0, -7.834307182970542, 1, 0.2825606574617523, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.846134379804498, 1.1538656201955, 1, 0, 0.6153781266014998, 0.5416723782078626, 0, -3.597246786464006, 1, 0.6153781266014998, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.003480762245986106, 2.996519237754014, 0, 1, 0.001160254081995368, 0, 0.3337205339450887, 2.216238388013851, 0.9988397459180046, 1, 0.1505797100844203],
[0, 2.142566434379112, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479912028365351, 2.152008797163464, 1, 0, 0.2826637342788452, 1.179257516652289, 0, -7.83145030622755, 1, 0.2826637342788452, 0.1505797100844203],
[0.6279079333296762, 2.372092066670322, 1, 0, 0.2093026444432255, 1.592590166359565, 0, -10.57639283185432, 1, 0.2093026444432255, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8468158982273564, 2.153184101772642, 2, 0, 0.2822719660757856, 2.361788440895606, 0, -15.68463931542639, 1, 0.07967746283228938, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.003366954282642, 1.996633045717356, 2, 0, 0.3344556514275475, 1.993288688115009, 0, -13.23743210155937, 1, 0.1118605827718252, 0.1505797100844203],
[0.8479892439574461, 2.152010756042552, 1, 0, 0.2826630813191489, 1.179260240770438, 0, -7.831468397098809, 1, 0.2826630813191489, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.37129530349955, 0, 2, 0.2091129369865107, 0, 0.8434208919692145, 5.601158957580427, 0.625502346442103, 1, 0.1505797100844203],
[0.9996739494288391, 2.00032605057116, 0, 1, 0.3332246498096132, 0, 0.4999185006436659, 3.319959245262154, 0.6667753501903868, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.845345082170498, 1.154077202370174, 1, 0, 0.6152335040256234, 0.5419040642652042, 0, -3.598785413794419, 1, 0.6152335040256234, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6961716108190891, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2582074553509576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.849019120150054, 1.150980879849944, 0, 0, 0.616339706716685, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5410935130544047, 1.980207056566689, 1, 0, 0.2146088885926526, 1.848109385668156, 0, -12.27329621389256, 1, 0.2146088885926526, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9349757389872206, 2.065024261012778, 0, 0, 0.311658579662407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -19.92300289539736, 1, 0.03703703703703698, 0.1505797100844203],
[0.9349757389872206, 2.065024261012778, 0, 0, 0.311658579662407, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9982722937199429, 2.001727706280056, 0, 1, 0.3327574312399811, 0, 0.4995684462290662, 3.317634533556948, 0.6672425687600189, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7526262434781757, 2.247373756521826, 0, 1, 0.2508754144927252, 0, 0.4449638148074051, 2.955005123584995, 0.7491245855072748, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.371464330823669, 0, 1, 0.2091011489311783, 0, 0.4216803883584768, 2.800379866066072, 0.7908988510688216, 1, 0.1505797100844203],
[1.84546239355948, 1.154537606440519, 0, 1, 0.6151541311864934, 0, 0.8661476199835846, 5.752087180258161, 0.3848458688135066, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9993649142605475, 2.000635085739451, 0, 1, 0.3331216380868493, 0, 0.4998412789658699, 3.319446416025381, 0.6668783619131506, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2180598073789629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480917318601173, 2.151908268139882, 1, 0, 0.2826972439533725, 1.179117732708822, 0, -7.830522000924076, 1, 0.2826972439533726, 0.1505797100844203],
[0.9314881608672372, 2.068511839132761, 2, 0, 0.3104960536224125, 2.14710189997257, 0, -14.25890578995556, 0.9999999999999999, 0.09640779931509214, 0.1505797100844203],
[0.432496612674772, 2.267893163520379, 1, 1, 0.1601608095569669, 2.312156837057076, 0.4409378784173994, -12.42676691030023, 0.974348515082057, 0.2946701341959908, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.84141488664523, 1.158007555447939, 2, 0, 0.6139231542723889, 1.086121337730514, 0, -7.212932852119295, 1, 0.3769016393517594, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5410935130544046, 2.155078097764683, 1, 0, 0.2006895669708585, 1.848109385668156, 0, -12.27329621389257, 1, 0.2006895669708585, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 1.979733044813165, 0, 0, 0.2147968914667388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9344268882413618, 2.065573111758637, 1, 0, 0.3114756294137874, 1.070174684166088, 0, -7.107031110407308, 1, 0.3114756294137874, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -13.28200193026491, 1, 0.1111111111111109, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.085956618837165, 1.065024261012779, 0, 0, 0.5048657703144823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9871964738137837, 2.012803526186215, 1, 2, 0.3290654912712614, 1.012969582576357, 0.9936389587857715, -0.1283746912498905, 0.7464128268746242, 0.6979767409327013, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6281792919573266, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2390169094930706, 1.591902204996487, 0, -10.57182407977815, 1, 0.2390169094930706, 0.1505797100844203],
[0.8459366777122732, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2972436752852442, 1.182121577591802, 0, -7.850470537691051, 1, 0.2972436752852442, 0.1505797100844203],
[2.550473554583235, 9.653183880684717, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.057919820817166, 9.145737614450786, 0, 0, 0.2505740461035831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[4.067885811755984, 8.135771623511967, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[2.550473554583235, 9.145737614450786, 0, 0, 0.218059807378963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[3.453712832767957, 8.749944602499992, 0, 0, 0.2830063733833517, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[2.372882685980577, 9.830774749287373, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02971253017088907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.1505797100844203],
[3.553691439694812, 7.138422333533136, 0, 2, 0.3323656589394814, 0, 0.2801739525279821, 8.266349525649652, 0.4457356133633129, 1, 0.03389331066374951],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.055694449492359, 1.819561078878806, 0, 0, 0.3671654359327188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.521300569621096, 0, 0, 0.3966207012558923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.913742215989445, 1, 0, 0.3432012600539616, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3432012600539616, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 1.7222640970395, 0, 0, 0.1993122239377376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8480906363001066, 2.151909363699892, 1, 1, 0.2826968787667023, 1.17911925588828, 0.4647035869023065, -4.744435147241599, 0.9200824747355643, 0.4854762322689691, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.849019120150054, 0, 0, 0.3509979953898418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 3.320500482566227, 0.6666666666666667, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8481562326383334, 1.999999999999999, 1, 0, 0.297791330025692, 1.179028062895124, 0, -7.82992650360476, 1, 0.297791330025692, 0.1505797100844203],
[0.6286264641172938, 2.371373535882704, 0, 1, 0.2095421547057647, 0, 0.4216965336200257, 2.8004870867636, 0.7904578452942352, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2980040092203164, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5833208688216041, 2.416679131178395, 0, 0, 0.1944402896072014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[0.8479871056241617, 2.152012894375837, 1, 0, 0.2826623685413874, 1.179263214461202, 0, -7.831488145382042, 1, 0.2826623685413874, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2386688225917956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.5415675248079288, 2.154604086011159, 0, 0, 0.2008653761632786, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[1.168545191489843, 1.458432475192071, 0, 0, 0.4448249432458293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9977747932268808, 2.002225206773118, 0, 1, 0.3325915977422937, 0, 0.4994443165619955, 3.31681018831813, 0.6674084022577063, 1, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150281826120912, 0, 1, 0.2830723343069793, 0, 0.4650553187272157, 3.088432820507419, 0.7169276656930207, 1, 0.1505797100844203],
[0.6285210181752872, 2.371478981824711, 0, 1, 0.2095070060584292, 0, 0.4216777832163454, 2.800362565314662, 0.7904929939415708, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6279079086191348, 2.372092091380864, 1, 0, 0.2093026362063784, 1.592590229033988, 0, -10.57639324807522, 1, 0.2093026362063783, 0.1505797100844203],
[0.8490191201500543, 2.150980879849945, 0, 0, 0.2830063733833516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.6274995290553784, 2.37250047094462, 0, 1, 0.2091665096851263, 0, 0.4214962282396708, 2.799156858539342, 0.7908334903148737, 1, 0.1505797100844203],
[0.8479907003407599, 2.152009299659239, 1, 0, 0.2826635667802534, 1.179258215447594, 0, -7.831454946927844, 1, 0.2826635667802534, 0.1505797100844203],
[0.6269776666819149, 2.373022333318084, 0, 0, 0.2089925555606384, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.7517221383107487, 2.248277861689253, 0, 0, 0.2505740461035828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -6.641000965132454, 1, 0.3333333333333333, 0.1505797100844203],
[1.055694449492359, 1.819561078878806, 0, 0, 0.3671654359327188, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203],
[0.4287167828104437, 1.7222640970395, 0, 0, 0.1993122239377376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1505797100844203]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.001394346395185721,
"Nucleotide GTR":0.001502674788073166,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node13":{
"Global MG94xREV":0.001393943295816104,
"Nucleotide GTR":0.001502240371444771,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.0003432104677608573,
"Nucleotide GTR":0.000369874888110816,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node186":{
"Global MG94xREV":0.0006011222227437777,
"Nucleotide GTR":0.0006478241072565495,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node187":{
"Global MG94xREV":0.0004493384770107318,
"Nucleotide GTR":0.000484248105812534,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node194":{
"Global MG94xREV":0.001393942002685294,
"Nucleotide GTR":0.001502238977849125,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.001398694884970956,
"Nucleotide GTR":0.001507361117086551,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node205":{
"Global MG94xREV":0.0009082025952065268,
"Nucleotide GTR":0.0009787619109508953,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.001395280571857962,
"Nucleotide GTR":0.001503681542017401,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node218":{
"Global MG94xREV":0.001383891052302262,
"Nucleotide GTR":0.001491407157442873,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":1.089847693395821e-05,
"Nucleotide GTR":1.174519228048394e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node227":{
"Global MG94xREV":0.001225107258093578,
"Nucleotide GTR":0.00132028726561699,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.001394867078284942,
"Nucleotide GTR":0.001503235923647852,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node236":{
"Global MG94xREV":0.001394452881330747,
"Nucleotide GTR":0.001502789547250631,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.001394356047158196,
"Nucleotide GTR":0.001502685189918605,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001204607479875645,
"Nucleotide GTR":0.001298194835790703,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node249":{
"Global MG94xREV":0.001394418839861219,
"Nucleotide GTR":0.001502752861059748,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node250":{
"Global MG94xREV":0.001393346110867407,
"Nucleotide GTR":0.00150159679050296,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.001394213459601274,
"Nucleotide GTR":0.001502531524568577,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":0.001194526584003667,
"Nucleotide GTR":0.001287330743395647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node265":{
"Global MG94xREV":0.0009249042763794961,
"Nucleotide GTR":0.0009967611651560987,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node268":{
"Global MG94xREV":0.001394366915754804,
"Nucleotide GTR":0.001502696902909124,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.001394555647215637,
"Nucleotide GTR":0.00150290029713662,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.0006882460159880394,
"Nucleotide GTR":0.0007417166493117189,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.000704851736332177,
"Nucleotide GTR":0.0007596124873797097,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node277":{
"Global MG94xREV":0.001393463717478283,
"Nucleotide GTR":0.001501723534108196,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node28":{
"Global MG94xREV":0.001394673841670961,
"Nucleotide GTR":0.001503027674256622,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.0005941850065609499,
"Nucleotide GTR":0.0006403479306813864,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node287":{
"Global MG94xREV":0.001394185532862177,
"Nucleotide GTR":0.001502501428168644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node292":{
"Global MG94xREV":0.001371541318323986,
"Nucleotide GTR":0.001478097958270673,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node293":{
"Global MG94xREV":2.314592293046264e-05,
"Nucleotide GTR":2.494415659866079e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.001393997779580214,
"Nucleotide GTR":0.001502299088115873,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node302":{
"Global MG94xREV":0.001136654450808726,
"Nucleotide GTR":0.001224962456874945,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.0009482884757727078,
"Nucleotide GTR":0.001021962110192984,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":0.001331155899427616,
"Nucleotide GTR":0.001434574949217197,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node318":{
"Global MG94xREV":0.001394300818539643,
"Nucleotide GTR":0.001502625670524454,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.001394745262480446,
"Nucleotide GTR":0.00150310464383185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.002792683461335468,
"Nucleotide GTR":0.003009650286978185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.001398175609355515,
"Nucleotide GTR":0.001506801498344696,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node331":{
"Global MG94xREV":0.001241423955707257,
"Nucleotide GTR":0.001337871626442499,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.001146511905263743,
"Nucleotide GTR":0.001235585748429525,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node337":{
"Global MG94xREV":0.0005782949636003494,
"Nucleotide GTR":0.0006232233718051011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.0006080347432475073,
"Nucleotide GTR":0.0006552736695165846,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node339":{
"Global MG94xREV":0.0002076122897033607,
"Nucleotide GTR":0.0002237419299167972,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.004180780492860422,
"Nucleotide GTR":0.00450559019106057,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.001159367472361357,
"Nucleotide GTR":0.001249440079484321,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"Global MG94xREV":0.0002352108827088946,
"Nucleotide GTR":0.0002534846897065442,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node385":{
"Global MG94xREV":0.0012637681931338,
"Nucleotide GTR":0.001361951813658181,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node389":{
"Global MG94xREV":0.0005962468466221618,
"Nucleotide GTR":0.0006425699574946085,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0006503684509850449,
"Nucleotide GTR":0.000700896332236908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node394":{
"Global MG94xREV":0.0005959620248865281,
"Nucleotide GTR":0.0006422630076271231,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node395":{
"Global MG94xREV":0.000646041383784756,
"Nucleotide GTR":0.0006962330901540056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node413":{
"Global MG94xREV":0.0008953571621969909,
"Nucleotide GTR":0.000964918501313262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0004982524241359722,
"Nucleotide GTR":0.0005369622343705621,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":0.001394844440830731,
"Nucleotide GTR":0.0015032115274635,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.001394547610181337,
"Nucleotide GTR":0.001502891635695778,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.001394172349343182,
"Nucleotide GTR":0.001502487220406729,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node431":{
"Global MG94xREV":0.0009740554565362117,
"Nucleotide GTR":0.001049730957655688,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node432":{
"Global MG94xREV":0.0004197728696309563,
"Nucleotide GTR":0.0004523855120144258,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node436":{
"Global MG94xREV":0.001026272756232307,
"Nucleotide GTR":0.001106005080087173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.000368447745898991,
"Nucleotide GTR":0.0003970728797352092,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node441":{
"Global MG94xREV":0.00102776615656794,
"Nucleotide GTR":0.001107614504431514,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node442":{
"Global MG94xREV":0.0003669221108376704,
"Nucleotide GTR":0.0003954287163118568,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.0008761626705466587,
"Nucleotide GTR":0.0009442327672858922,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node451":{
"Global MG94xREV":0.00080806891221093,
"Nucleotide GTR":0.0008708487256807789,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.000897145014213363,
"Nucleotide GTR":0.0009668452536318263,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.0004974673093038657,
"Nucleotide GTR":0.0005361161230541615,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.001394500920467544,
"Nucleotide GTR":0.001502841318603828,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node472":{
"Global MG94xREV":0.0003215129693789201,
"Nucleotide GTR":0.0003464916858481871,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node473":{
"Global MG94xREV":0.000606925119831283,
"Nucleotide GTR":0.0006540778381668054,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node477":{
"Global MG94xREV":0.0003227589846841748,
"Nucleotide GTR":0.0003478345055314628,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node478":{
"Global MG94xREV":0.0006082212696374709,
"Nucleotide GTR":0.0006554746873586921,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node482":{
"Global MG94xREV":0.001237411681555183,
"Nucleotide GTR":0.001333547634045791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node487":{
"Global MG94xREV":0.0006207951607805734,
"Nucleotide GTR":0.0006690254587265197,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node493":{
"Global MG94xREV":0.001096673646781824,
"Nucleotide GTR":0.001181875497690661,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node515":{
"Global MG94xREV":0.001394349531829041,
"Nucleotide GTR":0.001502678168405952,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.001386099057428224,
"Nucleotide GTR":0.001493786705054695,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node527":{
"Global MG94xREV":8.690759397389134e-06,
"Nucleotide GTR":9.365954601207358e-06,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node533":{
"Global MG94xREV":0.001392739073149374,
"Nucleotide GTR":0.001500942591318707,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node534":{
"Global MG94xREV":2.051663987366308e-06,
"Nucleotide GTR":2.211060148366054e-06,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.0009016503456084553,
"Nucleotide GTR":0.0009717006094621259,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.0004925244515432796,
"Nucleotide GTR":0.0005307892489262479,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node544":{
"Global MG94xREV":0.001394483794374343,
"Nucleotide GTR":0.00150282286196453,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.001394316780277334,
"Nucleotide GTR":0.001502642872348108,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node562":{
"Global MG94xREV":0.0009078552919217663,
"Nucleotide GTR":0.0009783876252700725,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.001394748614084858,
"Nucleotide GTR":0.001503108255826305,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "N", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAT", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node580":{
"Global MG94xREV":0.0005957000710040128,
"Nucleotide GTR":0.0006419807022428566,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node581":{
"Global MG94xREV":0.0006497801188348728,
"Nucleotide GTR":0.0007002622918778336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.001266796519141804,
"Nucleotide GTR":0.001365215413835302,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node591":{
"Global MG94xREV":0.001259876361766162,
"Nucleotide GTR":0.001357757621385892,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.001261768175914158,
"Nucleotide GTR":0.001359796412774985,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.001396361341237678,
"Nucleotide GTR":0.001504846277627023,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node611":{
"Global MG94xREV":0.001115089252994339,
"Nucleotide GTR":0.001201721833764806,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.00118545050837608,
"Nucleotide GTR":0.001277549536898243,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node617":{
"Global MG94xREV":0.0005759708061437588,
"Nucleotide GTR":0.0006207186478530127,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.0005969161693468372,
"Nucleotide GTR":0.0006432912806801012,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.001393721010580831,
"Nucleotide GTR":0.001502000816611081,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node625":{
"Global MG94xREV":0.001393456014657114,
"Nucleotide GTR":0.001501715232845893,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node631":{
"Global MG94xREV":0.0009019826719471389,
"Nucleotide GTR":0.0009720587546205154,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.001394715013071616,
"Nucleotide GTR":0.00150307204431127,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node644":{
"Global MG94xREV":0.001394862921197439,
"Nucleotide GTR":0.001503231443591389,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node680":{
"Global MG94xREV":0.001394675380636251,
"Nucleotide GTR":0.001503029332785914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.001194307613845513,
"Nucleotide GTR":0.001287094761191271,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node686":{
"Global MG94xREV":0.001395184250214333,
"Nucleotide GTR":0.001503577737033268,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node692":{
"Global MG94xREV":0.001395289892555481,
"Nucleotide GTR":0.001503691586850748,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node696":{
"Global MG94xREV":0.001170352196141131,
"Nucleotide GTR":0.001261278219228367,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.001173168173831942,
"Nucleotide GTR":0.001264312973500596,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node704":{
"Global MG94xREV":9.739012239307595e-05,
"Nucleotide GTR":0.0001049564742539766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.0005946398942155601,
"Nucleotide GTR":0.00064083815908686,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node710":{
"Global MG94xREV":0.0006511651414024801,
"Nucleotide GTR":0.0007017549184593219,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node714":{
"Global MG94xREV":0.0005974761715482252,
"Nucleotide GTR":0.0006438947901037251,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node715":{
"Global MG94xREV":0.0006504885376599348,
"Nucleotide GTR":0.0007010257485852145,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node719":{
"Global MG94xREV":0.001261622609308559,
"Nucleotide GTR":0.00135963953693052,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node722":{
"Global MG94xREV":0.001259321867691182,
"Nucleotide GTR":0.001357160048021423,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":0.001261706397855457,
"Nucleotide GTR":0.001359729835107063,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node728":{
"Global MG94xREV":0.001257835936967902,
"Nucleotide GTR":0.001355558673612307,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.001257852642938952,
"Nucleotide GTR":0.001355576677489674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"Global MG94xREV":0.001261739913274545,
"Nucleotide GTR":0.001359765954378033,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":0.001272480103317315,
"Nucleotide GTR":0.001371340562274688,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node740":{
"Global MG94xREV":0.001257852642938952,
"Nucleotide GTR":0.001355576677489674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node743":{
"Global MG94xREV":0.001264972673797221,
"Nucleotide GTR":0.001363249871824999,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node747":{
"Global MG94xREV":0.001257852642938952,
"Nucleotide GTR":0.001355576677489674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.001264972673797221,
"Nucleotide GTR":0.001363249871824999,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node754":{
"Global MG94xREV":0.001257852642938952,
"Nucleotide GTR":0.001355576677489674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node757":{
"Global MG94xREV":0.001257852642938952,
"Nucleotide GTR":0.001355576677489674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node760":{
"Global MG94xREV":0.0005382576055441871,
"Nucleotide GTR":0.00058007546484326,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node766":{
"Global MG94xREV":0.0005931576257643597,
"Nucleotide GTR":0.0006392407314759978,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node767":{
"Global MG94xREV":0.0006437812505172254,
"Nucleotide GTR":0.0006937973645046765,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node774":{
"Global MG94xREV":0.001394392560909752,
"Nucleotide GTR":0.001502724540465981,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node777":{
"Global MG94xREV":0.001389843066236182,
"Nucleotide GTR":0.001497821590260746,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node778":{
"Global MG94xREV":4.949800295350063e-06,
"Nucleotide GTR":5.334356036276732e-06,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node785":{
"Global MG94xREV":0.001376117161808346,
"Nucleotide GTR":0.001483029304356451,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node788":{
"Global MG94xREV":0.001389219064758046,
"Nucleotide GTR":0.001497149109382138,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node789":{
"Global MG94xREV":5.57122616873645e-06,
"Nucleotide GTR":6.004061208404849e-06,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node795":{
"Global MG94xREV":0.001394726760084396,
"Nucleotide GTR":0.001503084703963138,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":0.001259885650626918,
"Nucleotide GTR":0.001357767631909042,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node809":{
"Global MG94xREV":0.001246024163556914,
"Nucleotide GTR":0.001342829229789441,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node814":{
"Global MG94xREV":0.001259885650626918,
"Nucleotide GTR":0.001357767631909042,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node819":{
"Global MG94xREV":0.001261067772290844,
"Nucleotide GTR":0.001359041593979696,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node824":{
"Global MG94xREV":0.001259885650626918,
"Nucleotide GTR":0.001357767631909042,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node829":{
"Global MG94xREV":0.001259868895970618,
"Nucleotide GTR":0.001357749575564011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node834":{
"Global MG94xREV":0.001259868895970618,
"Nucleotide GTR":0.001357749575564011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node95":{
"Global MG94xREV":0.001394631980703187,
"Nucleotide GTR":0.001502982561061583,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCN", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0031731257416025,
"Nucleotide GTR":0.003018956996921477,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "A", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GCT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001578987115609437,
"Nucleotide GTR":0.001502270817137737,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579573369274718,
"Nucleotide GTR":0.001502828587219635,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001481202426857423,
"Nucleotide GTR":0.001409237072389065,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "P", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "CCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001584547784978512,
"Nucleotide GTR":0.0015075613171262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001530045190447958,
"Nucleotide GTR":0.0001455706772898369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580134965967301,
"Nucleotide GTR":0.001503362898306743,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007799422663084591,
"Nucleotide GTR":0.007420481738859751,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "KQE", "S", "E", "L", "V", "I", "RGW", "P", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "ILVF", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "YSCF", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "V", "H", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTN", "NAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "NGG", "CCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "NTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TNT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GTG", "CAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.006399871868334184,
"Nucleotide GTR":0.006088929191488931,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "QPRL", "T", "RS", "P", "M", "ILV", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CNG", "ACT", "AGN", "CCC", "ATG", "NTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 2, 0, 1.5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KTRM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ANG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "TPAS", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "NCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418676_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "YSCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418676_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "ILVF", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "NTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418703_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579081577507104,
"Nucleotide GTR":0.001502360689531749,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "SRGC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YSCF", "S", "SRGC", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "NGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TNC", "AGT", "NGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "KN", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAN", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "SRGC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "NGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "ED", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAN", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCN", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579164772057688,
"Nucleotide GTR":0.001502439842011369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "SRGC", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "NGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAN", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420679_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001578501842403501,
"Nucleotide GTR":0.001501809121302216,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420679_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003165255960716462,
"Nucleotide GTR":0.0003011469575367817,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420760_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "ED", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAN", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420760_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCN", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "KTRI", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ANA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00157970506385404,
"Nucleotide GTR":0.001502953883316947,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "V", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GTG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421787_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KN", "HPRL", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAN", "CNC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "SL", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TNA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTN", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "HPRL", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TPAS", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CNC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "NCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00157938058881819,
"Nucleotide GTR":0.001502645173149253,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTC", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580856686344316,
"Nucleotide GTR":0.001504049553346422,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "H", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "CAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "YSCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "TPAS", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "NCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423216_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCN", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "DAGV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GNT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579752761522728,
"Nucleotide GTR":0.001502999263557868,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "V", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423427_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "DAGV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GNC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002503810269871212,
"Nucleotide GTR":0.0002382160730061124,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423528_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTN", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "DAGV", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GNT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423653_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001580720407881184,
"Nucleotide GTR":0.001503919896076805,
"amino-acid": [
["M", "A", "DAGV", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GNT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGT", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423718_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "EDAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNN", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423815_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "SRGC", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "NGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579752765306406,
"Nucleotide GTR":0.001502999267157712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424040_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "NTSI", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ANC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001524823318357737,
"Nucleotide GTR":0.0001450738609463462,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579374498538364,
"Nucleotide GTR":0.001502639378770336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "R", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AGG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579512048389635,
"Nucleotide GTR":0.001502770245656725,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425380_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581901702470267,
"Nucleotide GTR":0.001505043796563441,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "M", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "ATG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006640090183791838,
"Nucleotide GTR":0.0006317476316089595,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581956294375401,
"Nucleotide GTR":0.001505095736079049,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTA", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579213125357972,
"Nucleotide GTR":0.001502485846029523,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580702730960564,
"Nucleotide GTR":0.001503903078002915,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579380585081684,
"Nucleotide GTR":0.001502645169594288,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "S", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TCA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580188021137578,
"Nucleotide GTR":0.001503413375750933,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGG", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582090211485724,
"Nucleotide GTR":0.001505223146723991,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGA", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001508854707134843,
"Nucleotide GTR":0.0001435545845448338,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00106725272077747,
"Nucleotide GTR":0.001015399429852864,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579374494680115,
"Nucleotide GTR":0.001502639375099545,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTG", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "ILVF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "LF", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "NTT", "CTN", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTN", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NTSI", "R", "P", "ILVF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ANC", "AGA", "CCG", "NTT", "CTN", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "ILVF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "NTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579240094181441,
"Nucleotide GTR":0.001502511504552046,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACN", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":2.111464752925455e-05,
"Nucleotide GTR":2.008877620581829e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002949944244887862,
"Nucleotide GTR":0.0002806618944175485,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580103263380619,
"Nucleotide GTR":0.001503332736014519,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "Y", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579752765306406,
"Nucleotide GTR":0.001502999267157712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "Y", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "TAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579173187408654,
"Nucleotide GTR":0.001502447848496063,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "TTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "ED", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAN", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579374498538364,
"Nucleotide GTR":0.001502639378770336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "S", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AGT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIHPRLDAGVYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "NNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429065_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "CW", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGN", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIHPRLDAGVYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "NNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "ILV", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "NTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580592464650695,
"Nucleotide GTR":0.001503798169066173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCA", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579268851560265,
"Nucleotide GTR":0.001502538864731593,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001550957836639047,
"Nucleotide GTR":0.0001475603362155765,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585113614264729,
"Nucleotide GTR":0.001508099655163134,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "A", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "GCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001579517379314344,
"Nucleotide GTR":0.001502775317574372,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579773606654375,
"Nucleotide GTR":0.001503019095912823,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579114470054635,
"Nucleotide GTR":0.001502391983969666,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCT", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001578394418267848,
"Nucleotide GTR":0.00150170691645048,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NTSI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "RGW", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "SRGC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ANT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "NGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "NGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TPAS", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "NCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579752765306406,
"Nucleotide GTR":0.001502999267157712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTN", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTN", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "DAGV", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "KN", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GNT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAN", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "TPAS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "IM", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "ILVF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "NCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATN", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "NTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "NHDY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "YSCF", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "QPRL", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "NAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACN", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TNC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CNA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTN", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "NHDY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YSCF", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "NAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TNC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "TPAS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "QHPRL", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "NTSI", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "NCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTN", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CNN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ANT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NTSI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ANT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "ED", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "NHDY", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAN", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAN", "NAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "NHDY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "NAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "CW", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "NHDY", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "DAGV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGN", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "NAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GNC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YSCF", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TNC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IM", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATN", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579374498538364,
"Nucleotide GTR":0.001502639378770336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGG", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "ED", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAN", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001580288311211111,
"Nucleotide GTR":0.001503508793154426,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432711_England_20200312_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001578840074856069,
"Nucleotide GTR":0.001502130920472002,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACT", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001587475091257586,
"Nucleotide GTR":0.001510346397987471,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "HPRL", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "RG", "H", "H", "L", "RG", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTT", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CNC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "NGA", "CAC", "CAT", "CTA", "NGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579752765306406,
"Nucleotide GTR":0.001502999267157712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001579069508361179,
"Nucleotide GTR":0.001502349206774524,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "T", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ACT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00158435237555362,
"Nucleotide GTR":0.001507375401817894,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "Q", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "CAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001581030737495475,
"Nucleotide GTR":0.001504215148089084,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGC", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433666_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002372522627761242,
"Nucleotide GTR":0.0002257251798605711,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433845_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001452414701018975,
"Nucleotide GTR":0.0001381848020261071,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433949_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433959_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579380585055353,
"Nucleotide GTR":0.001502645169569236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTC", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433959_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579752765306406,
"Nucleotide GTR":0.001502999267157712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003181382588607035,
"Nucleotide GTR":0.003026812678689785,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "QHPRL", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "M", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTC", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CNN", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ATG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00157980898031793,
"Nucleotide GTR":0.001503052750919842,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "L", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CTT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580440408325273,
"Nucleotide GTR":0.001503653500513792,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCT", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001719984834556396,
"Nucleotide GTR":0.0001636418053909363,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550375431504,
"Nucleotide GTR":0.001502806710549907,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "L", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "CTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KN", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AA-", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579828057253863,
"Nucleotide GTR":0.001503070900988233,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001580083289062273,
"Nucleotide GTR":0.001503313732163726,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580246915428367,
"Nucleotide GTR":0.001503469408617494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580103259470056,
"Nucleotide GTR":0.001503332732293954,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579766601336446,
"Nucleotide GTR":0.001503012430953635,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "KTRMQPLEAGVSW", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "CW", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "--G", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TG-", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 22.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003170700022260548,
"Nucleotide GTR":0.003016649133011788,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "I", "A", "Y", "A", "N", "R", "K", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "ATT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAA", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582090215608774,
"Nucleotide GTR":0.001505223150646718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "K", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAA", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435612_California_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580083292821084,
"Nucleotide GTR":0.001503313735739914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435612_California_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579213654053743,
"Nucleotide GTR":0.001502486349038204,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "L", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "CTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001579886813667738,
"Nucleotide GTR":0.001503126802676734,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00157938058881819,
"Nucleotide GTR":0.001502645173149253,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACC", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00157970506385404,
"Nucleotide GTR":0.001502953883316947,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581874307829595,
"Nucleotide GTR":0.001505017732912369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "D", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GAC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "YSCF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "ILVF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TNT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "NTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KQE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCN", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "NAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "IM", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATN", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579808980179971,
"Nucleotide GTR":0.001503052750788585,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001581635975384824,
"Nucleotide GTR":0.001504790980031986,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "M", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "ATG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005506217603892025,
"Nucleotide GTR":0.0005238693803998789,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "ILVF", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "NTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "DAGV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GNT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCN", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "NHDY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "KTRM", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "NAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "ANG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "KTRM", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "ANG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "ILVF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "NTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001580001207597286,
"Nucleotide GTR":0.00150323563868959,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "V", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "GTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "KTRM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ANG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "NTSIHPRLDAGVYCF", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "NNC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0002277560777420281,
"Nucleotide GTR":0.000216690374250168,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579882917180554,
"Nucleotide GTR":0.001503123095503363,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "TTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001534201572938227,
"Nucleotide GTR":0.0001459661214361675,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003160610550149108,
"Nucleotide GTR":0.003007049865631134,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATC", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579837353923525,
"Nucleotide GTR":0.001503079745972077,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001672974028334121,
"Nucleotide GTR":0.0001591691303716354,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579228552333525,
"Nucleotide GTR":0.001502500523473648,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001693033575130534,
"Nucleotide GTR":0.0001610776242066615,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001729021533710335,
"Nucleotide GTR":0.000164501569811305,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACN", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001579265082596818,
"Nucleotide GTR":0.00150253527888612,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582294133338532,
"Nucleotide GTR":0.00150541716087738,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "D", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GAT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581095098589169,
"Nucleotide GTR":0.001504276382149743,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001466728039451753,
"Nucleotide GTR":0.0001395465934182475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579220460367866,
"Nucleotide GTR":0.001502492824662343,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAG", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTN", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001468717477959726,
"Nucleotide GTR":0.001397358714296686,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001681076936549072,
"Nucleotide GTR":0.0001599400525929082,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438422_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGN", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438422_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "ILVF", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "NTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438435_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACN", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438511_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438615_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001578582469036506,
"Nucleotide GTR":0.001501885830628501,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTG", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438615_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579484543840663,
"Nucleotide GTR":0.001502744077437334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "G", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GGG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAN", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "ILVF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "NTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582090215509646,
"Nucleotide GTR":0.001505223150552408,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "Q", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAA", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "CW", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGN", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002280050031999082,
"Nucleotide GTR":0.0002169272054740074,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439409_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.000526973428249507,
"Nucleotide GTR":0.0005013700205911479,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "QPRL", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "NHDY", "SRGC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CNA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "NAT", "NGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439458_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440007_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001503148387785207,
"Nucleotide GTR":0.0001430116771995184,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440007_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "H", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "CAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440052_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001382238279275936,
"Nucleotide GTR":0.0001315081173721586,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "HPRL", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CNC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCN", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTN", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "KN", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAN", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440436_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440521_England_20200304_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440521_England_20200304_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "CW", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGN", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440988_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001529810274289975,
"Nucleotide GTR":0.0001455483270321863,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440988_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441046_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "ILVF", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "NTC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACN", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441198_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001529810278162025,
"Nucleotide GTR":0.0001455483274005785,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441250_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":7.649424403388434e-05,
"Nucleotide GTR":7.277771259505398e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441307_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441318_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "ILVF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "NTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441318_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580440404307655,
"Nucleotide GTR":0.001503653496691373,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441573_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441625_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003182197891815385,
"Nucleotide GTR":0.003027588369767256,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "-", "KN", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "---", "AA-", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7.833333333333334, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441625_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.166666666666667, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441875_England_20200429_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441875_England_20200429_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579391797955371,
"Nucleotide GTR":0.001502655837681919,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442012_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "DAGV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "SRGC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GNT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "NGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "QPRL", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CNA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442072_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442078_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001653020176060492,
"Nucleotide GTR":0.0001572706924639529,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442078_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442107_England_20200405_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "KN", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAN", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442107_England_20200405_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580050154203437,
"Nucleotide GTR":0.001503282207187387,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "T", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "ACA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442149_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442216_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442216_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001580440408325273,
"Nucleotide GTR":0.001503653500513792,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "F", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TTT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442224_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442344_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442344_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTN", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "ILVF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "NTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442625_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580677635735366,
"Nucleotide GTR":0.001503879202048458,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442782_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005531901830962232,
"Nucleotide GTR":0.0005263130143223386,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442846_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442982_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000155095783618997,
"Nucleotide GTR":0.0001475603361728503,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442982_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "YSCF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TNT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "ED", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAN", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443318_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "SRGC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "NGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443337_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "KTRI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ANA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443412_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443478_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001579380585081684,
"Nucleotide GTR":0.001502645169594288,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAC", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443478_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005246562481999047,
"Nucleotide GTR":0.0004991654225091507,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443629_England_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443648_England_20200416_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443648_England_20200416_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443657_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001577838431950212,
"Nucleotide GTR":0.001501177943153954,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443673_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001579693098495473,
"Nucleotide GTR":0.001502942499304491,
"amino-acid": [
["M", "V", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443680_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443713_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580440404307655,
"Nucleotide GTR":0.001503653496691373,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "H", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAT", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443744_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443766_England_20200328_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "LF", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTN", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443766_England_20200328_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "KN", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAN", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443875_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "ED", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAN", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443875_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444077_California_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001580083292831938,
"Nucleotide GTR":0.001503313735750241,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444077_California_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001580083292910301,
"Nucleotide GTR":0.001503313735824796,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001578343505058689,
"Nucleotide GTR":0.001501658476898586,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444084_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444368_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAN", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444368_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444418_England_20200419_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0001482952701576912,
"Nucleotide GTR":0.0001410902308670647,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444418_England_20200419_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTC", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579789300526984,
"Nucleotide GTR":0.001503034027286611,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582322143527472,
"Nucleotide GTR":0.001505443810169835,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "N", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "AAT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003372452814164914,
"Nucleotide GTR":0.0003208599610984507,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580083292821084,
"Nucleotide GTR":0.001503313735739914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCT", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007938842500213471,
"Nucleotide GTR":0.00755312775641005,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "F", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "TTT", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.75, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.25, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580680271867539,
"Nucleotide GTR":0.001503881710102129,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "N", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AAT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445096_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579484543840663,
"Nucleotide GTR":0.001502744077437334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445174_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "RS", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGN", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445178_California_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "L", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "CTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000146673087744101,
"Nucleotide GTR":0.0001395468634285851,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "NHDY", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "NAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001503674783222319,
"Nucleotide GTR":0.000143061759210678,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005571788081009102,
"Nucleotide GTR":0.0005301078489259978,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAN", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "RS", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGN", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583946228518716,
"Nucleotide GTR":0.001506988987747776,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCN", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001070556726385618,
"Nucleotide GTR":0.001018542907817766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "SRGC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "NGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579380585055353,
"Nucleotide GTR":0.001502645169569236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTC", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005050206835573971,
"Nucleotide GTR":0.0004804838668150907,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "NHDY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "NAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "ILV", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "NTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "TPAS", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "NCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00157964816939824,
"Nucleotide GTR":0.001502899753121862,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001578938438406533,
"Nucleotide GTR":0.001502224504954021,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579819891987154,
"Nucleotide GTR":0.001503063132437261,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "T", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "NHDY", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "NAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "KN", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAN", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTN", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000152183947157283,
"Nucleotide GTR":0.000144789973516014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580114565585136,
"Nucleotide GTR":0.00150334348909277,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001579114884795528,
"Nucleotide GTR":0.001502392378560055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTN", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "HPRL", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CNT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IM", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATN", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579882711833205,
"Nucleotide GTR":0.001503122900132972,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00157982805334331,
"Nucleotide GTR":0.001503070897267676,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "V", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GTA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579380585055353,
"Nucleotide GTR":0.001502645169569236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "T", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ACA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "MLV", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "NTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTN", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "LF", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTN", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002541182054453492,
"Nucleotide GTR":0.0002417716777863733,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0001529810278162025,
"Nucleotide GTR":0.0001455483274005785,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580083292821084,
"Nucleotide GTR":0.001503313735739914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447679_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579484562470868,
"Nucleotide GTR":0.001502744095162375,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "DAGV", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GNT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "RS", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGN", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447936_England_20200428_null_26":{
"Global MG94xREV":0.0001550957834881689,
"Nucleotide GTR":0.000147560336048379,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447936_England_20200428_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448097_England_20200506_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580083292847498,
"Nucleotide GTR":0.001503313735765046,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "F", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "TTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448097_England_20200506_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448100_England_20200508_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448100_England_20200508_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001579419098322502,
"Nucleotide GTR":0.001502681811639802,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001579550378129743,
"Nucleotide GTR":0.001502806713117051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATC", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "LF", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTN", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448334_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448426_England_20200429_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0001530045186558529,
"Nucleotide GTR":0.0001455706769197912,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448426_England_20200429_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448433_England_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582682505434756,
"Nucleotide GTR":0.001505786663617829,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "K", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AAA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "ED", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAN", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448615_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580856686320706,
"Nucleotide GTR":0.00150404955332396,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "CGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448657_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005871490866431658,
"Nucleotide GTR":0.0005586219985288855,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448684_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448819_England_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448819_England_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448906_England_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580083292821084,
"Nucleotide GTR":0.001503313735739914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448906_England_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000155114124249293,
"Nucleotide GTR":0.0001475777857095751,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001580298070870198,
"Nucleotide GTR":0.001503518078632998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTA", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGN", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448978_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAN", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449004_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAN", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449030_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580175677708731,
"Nucleotide GTR":0.001503401632037032,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTC", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001550957834881689,
"Nucleotide GTR":0.000147560336048379,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001550957836620801,
"Nucleotide GTR":0.0001475603362138404,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0001779150932513125,
"Nucleotide GTR":0.0001692709521677294,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001780669524922979,
"Nucleotide GTR":0.0001694154332111716,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449579_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "TPAS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "NCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449579_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449605_England_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002509774009009106,
"Nucleotide GTR":0.0002387834716364945,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449605_England_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449658_England_20200411_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449658_England_20200411_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581622453380526,
"Nucleotide GTR":0.001504778115004623,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCA", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449684_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCN", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001579220441730083,
"Nucleotide GTR":0.001502492806930088,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001579828057253863,
"Nucleotide GTR":0.001503070900988233,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "L", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TTG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001580083292910301,
"Nucleotide GTR":0.001503313735824796,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001579543289650042,
"Nucleotide GTR":0.001502799969036564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001681662890707298,
"Nucleotide GTR":0.001599958011055705,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CT-", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003165935762768348,
"Nucleotide GTR":0.003012116348716307,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCA", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450234_California_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450234_California_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48":{
"Global MG94xREV":0.0001676954483921572,
"Nucleotide GTR":0.0001595478365820173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579484543840663,
"Nucleotide GTR":0.001502744077437334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "S", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AGC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550378138769,
"Nucleotide GTR":0.001502806713125639,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGC", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450454_California_20200325_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001579815779250472,
"Nucleotide GTR":0.001503059219521038,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450454_California_20200325_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450472_California_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450472_California_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582322143527472,
"Nucleotide GTR":0.001505443810169835,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "I", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "ATT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001579655182977531,
"Nucleotide GTR":0.00150290642594103,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "F", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TTT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "MLV", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "NTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582479954526471,
"Nucleotide GTR":0.001505593953800572,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "I", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "ATC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001580083292847498,
"Nucleotide GTR":0.001503313735765046,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "F", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "TTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001579164775887023,
"Nucleotide GTR":0.001502439845654653,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "T", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ACT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003168905753467997,
"Nucleotide GTR":0.003014942040142883,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "K", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "AAA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579584270692513,
"Nucleotide GTR":0.001502838958983696,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002810628593570908,
"Nucleotide GTR":0.0002674072050489647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001578803595100361,
"Nucleotide GTR":0.001502096213113165,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "V", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "GTG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "LF", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "KTRM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTN", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ANG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "ILVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "NTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "KTRI", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "KTRM", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "LF", "A", "A", "NHDY", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ANA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ANG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTN", "GCT", "GCA", "NAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "ILVF", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "NTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "EAGV", "D", "YSCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "ILVF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GNA", "GAT", "TNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "NTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "KTRI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ANA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCN", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "SRGC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "NGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "SRGC", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "IM", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "NGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATN", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTN", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DAGV", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "DAGV", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GNT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GNT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "KTRI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ANA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTN", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "YSCF", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TNT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "SWL", "MLV", "RGW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TNG", "NTG", "NGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "TPAS", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "DAGV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTN", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "NCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GNT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001504813153320543,
"Nucleotide GTR":0.0001431700653621822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTN", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTN", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "ILV", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "NTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001579550396814171,
"Nucleotide GTR":0.00150280673089368,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCC", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001925877620663623,
"Nucleotide GTR":0.0001832307381295472,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "ED", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "IM", "KN", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAN", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATN", "AAN", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "YSCF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "RS", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TNT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGN", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTN", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAN", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "KN", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAN", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "IM", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "NTSI", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATN", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ANT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "NHDY", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "SWL", "MLV", "RGW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "NAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TNG", "NTG", "NGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCN", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "EAGV", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GNG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "NTSI", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ANC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCN", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "NTSI", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ANT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00316223846019605,
"Nucleotide GTR":0.003008598682421511,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "C", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "P", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "TGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "CCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158187474701628,
"Nucleotide GTR":0.001505018150760834,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "I", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "ATC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "TPAS", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "NCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "QH", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAN", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTN", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "ILVF", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "NTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "YSCF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TNT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DAGV", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GNT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451967_Moscow_20200321_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451967_Moscow_20200321_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00157981989197987,
"Nucleotide GTR":0.001503063132430327,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "H", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CAT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001579705063942587,
"Nucleotide GTR":0.001502953883401191,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAT", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_257":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_257",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_73":{
"Global MG94xREV":0.0009073970669193506,
"Nucleotide GTR":0.0008633104853823879,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_73",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_242":{
"Global MG94xREV":0.0005317316227769497,
"Nucleotide GTR":0.000505897034592832,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_242",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00157871897641646,
"Nucleotide GTR":0.001502015705692836,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_232":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_232",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452141_Mexico_20200311_null_505":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452141_Mexico_20200311_null_505",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002176535958312061,
"Nucleotide GTR":0.0002070787291612012,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452165_Utah_20200416_null_28185":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452165_Utah_20200416_null_28185",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "KN", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAN", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7665.621678697498,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01847924930484067],
[0.01579941154641104],
[0.01184677911387738],
[0.02548892655984672],
[0.01550935886664613],
[0.01326021092701709],
[0.009942825363738257],
[0.02139247664344767],
[0.01622909070452978],
[0.01387556814863323],
[0.0104042350218892],
[0.02238522216335331],
[0.02770754913248837],
[0.02368943480685198],
[0.01776290848965981],
[0.03821776920377068],
[0.01349179777437805],
[0.0115352340358606],
[0.008649396165692207],
[0.01860960025802252],
[0.0113234650383895],
[0.009681350217297437],
[0.007259309450323478],
[0.01561876048129815],
[0.01184894506457021],
[0.01013062578342518],
[0.007596187085135555],
[0.01634356924246779],
[0.02022942834702993],
[0.0172957817999477],
[0.01296879355182982],
[0.02790299567797151],
[0.01595572848908644],
[0.01364184858179473],
[0.01022898646438481],
[0.02200816629280736],
[0.01339140541013144],
[0.01144940044745645],
[0.008585036074850316],
[0.01847112636456297],
[0.01401285088125318],
[0.01198072466901634],
[0.008983435766647866],
[0.01932830285009379],
[0.02392381442357616],
[0.02045441260100491],
[0.01533721096361085],
[0.03299876195264049],
[0.0134079762622485],
[0.02163086398887131],
[0.01316182662346826],
[0.01125311489099354],
[0.008437856439467708],
[0.01815446215724455],
[0.01177533022768477],
[0.008829426070114195],
[0.01899694343107224],
[0.02351367074414095],
[0.02010374744801849],
[0.01507427379040279],
[0.03243303972271359]
],
"Log Likelihood":-3243.347851963139,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5704112714364759, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.4500875325129716, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":586
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8293.400229156276,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2538304374276903],
[0.2189178069185243],
[0.2084559741460859],
[0.3187957815076995]
],
"Log Likelihood":-3285.228536025206,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2718326450559088,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3668407032911215,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2503958141166354,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.137818791449429,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.8890446195341221
},
"display order":0,
"estimated parameters":859
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-27/sequences.M.compressed.fas",
"number of sequences":427,
"number of sites":234,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_448097_England_20200506_null_4,(epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1)Node760,(epi_isl_420760_England_20200327_null_1,epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6)Node743,(epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_447936_England_20200428_null_26)Node740,(epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_1)Node737,(epi_isl_440007_England_20200321_null_3,epi_isl_440436_England_20200316_null_2)Node734,(epi_isl_442982_England_20200407_null_5,epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2)Node731,(epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2,epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4)Node728,(epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1,epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1)Node725,(epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4,epi_isl_443875_England_20200330_null_2)Node722,(epi_isl_442072_England_20200405_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1)Node719,((epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1,epi_isl_442078_England_20200405_null_4)Node715,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1)Node714,((epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2,epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48)Node710,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1)Node709,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_443318_England_20200415_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_442621_England_20200412_null_1,epi_isl_441318_England_20200403_null_1,epi_isl_441103_England_20200401_null_1,epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3,(((epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3,epi_isl_433666_England_20200403_null_2,epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66)Node187,epi_isl_443766_England_20200328_null_7)Node186,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1)Node185,(epi_isl_438422_England_20200329_null_2,epi_isl_442782_England_20200407_null_4,(epi_isl_438615_England_20200421_null_1,epi_isl_443412_England_20200416_null_4)Node197,epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15)Node194,epi_isl_447679_France_20200301_null_1,epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1,epi_isl_423427_England_20200331_null_1,epi_isl_450495_GP_20200325_null_1,epi_isl_441875_England_20200429_null_6,epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1,epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2,(epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1,epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1)Node205,(epi_isl_448896_England_20200413_null_3,epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1)Node208,((epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1)Node242,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4,epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20)Node241,(epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_420679_England_20200328_null_2,epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1)Node236,(((epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1,epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1)Node227,epi_isl_452141_Mexico_20200311_null_505,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1)Node219,epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13)Node218,(epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1,epi_isl_448819_England_20200324_null_5)Node231,((epi_isl_443673_England_20200412_null_1,epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1)Node250,epi_isl_448433_England_20200429_null_9)Node249,((epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7,epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5)Node255,epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4,epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12)Node254,(epi_isl_443648_England_20200416_null_9,epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1)Node287,((((epi_isl_443337_England_20200415_null_1,epi_isl_443657_England_20200413_null_7)Node277,epi_isl_449700_England_20200416_null_3)Node276,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2)Node275,(epi_isl_423815_England_20200323_null_1,epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_73)Node283,epi_isl_451967_Moscow_20200321_null_22)Node274,epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_32,(epi_isl_423718_England_20200323_null_2,epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_242)Node265,(epi_isl_425380_England_20200318_null_1,epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7)Node268,(epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1,epi_isl_442065_England_20200404_null_1)Node302,((epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4,epi_isl_444084_England_20200404_null_1)Node293,epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1)Node292,(epi_isl_445178_California_20200405_null_1,epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2,epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19)Node297,(epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2)Node110,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1,epi_isl_424040_England_20200321_null_1,epi_isl_448657_England_20200101_null_1,epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2,epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1,(((epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5,epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1)Node339,epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1)Node338,epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1)Node337,(epi_isl_438511_England_20200401_null_2,epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2)Node334,(epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_441307_England_20200401_null_2)Node314,(epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1,epi_isl_449579_England_20200401_null_2)Node310,epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9,(epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4,((epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1)Node321,epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1)Node320,epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4)Node318,((epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)Node331,epi_isl_423067_England_20200324_null_1,epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16)Node327,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_438435_England_20200329_null_1,((epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node581,epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2)Node580,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,((epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1)Node395,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1)Node394,((epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1)Node390,epi_isl_423445_England_20200327_null_1)Node389,epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1,(epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_444418_England_20200419_null_17)Node385,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1,epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1,epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1,(epi_isl_444368_England_20200428_null_1,epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1,epi_isl_448100_England_20200508_null_16)Node369,((epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1)Node375,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1)Node374,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,(epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6)Node482,((epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_443680_England_20200413_null_5,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13)Node456,epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1)Node455,((epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1)Node442,epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1)Node441,((epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1,epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26)Node437,epi_isl_442107_England_20200405_null_6)Node436,((epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1)Node432,epi_isl_448334_England_20200423_null_2)Node431,(epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1,epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3,epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1)Node426,(epi_isl_442344_England_20200325_null_3,epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10)Node423,((epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_232,epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1)Node414,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1)Node413,(epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1)Node420,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_448684_England_20200101_null_1)Node448,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1)Node451,(epi_isl_441198_England_20200403_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_2,epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1)Node465,epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2,((epi_isl_418676_England_20200310_null_1,epi_isl_439434_England_20200401_null_9)Node473,epi_isl_429065_California_20200328_null_1)Node472,((epi_isl_443629_England_20200417_null_4,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1)Node478,epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2)Node477,(epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2)Node493,(epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_448978_England_20200421_null_1)Node487,epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1,epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1,epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1,epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1,epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1,(epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51)Node515,epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1,epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,((epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2,epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_257)Node527,epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2)Node526,((epi_isl_432711_England_20200312_null_17,epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5)Node534,epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2)Node533,((epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3)Node540,epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1)Node539,(epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3,epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13)Node544,(epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1,epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21)Node565,(epi_isl_439458_England_20200330_null_1,epi_isl_442846_England_20200411_null_1)Node562,epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5,(epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4,epi_isl_450234_California_20200314_null_8)Node555,epi_isl_441625_England_20200404_null_1,epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1,epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,(epi_isl_433949_England_20200412_null_2,epi_isl_440230_England_20200323_null_1)Node586,epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1,(epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1)Node591,epi_isl_423856_England_20200317_null_1,(epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1)Node596,epi_isl_423653_England_20200323_null_1,epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1,epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1,((epi_isl_423528_England_20200326_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1)Node618,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1)Node617,(epi_isl_433845_England_20200408_null_1,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2)Node614,(epi_isl_420758_England_20200327_null_1,epi_isl_424156_England_20200320_null_1)Node611,(epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1)Node607,epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1,((epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1)Node625,epi_isl_441046_England_20200404_null_1)Node624,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,(epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1)Node631,epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_448906_England_20200330_null_4,(epi_isl_423362_England_20200328_null_4,epi_isl_449658_England_20200411_null_11)Node641,(epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14)Node644,epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2,epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1,epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_443381_England_20200412_null_1,epi_isl_443713_England_20200330_null_1,epi_isl_448615_England_20200101_null_1,epi_isl_449004_England_20200419_null_1,(epi_isl_449605_England_20200427_null_3,epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2)Node699,(epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2,epi_isl_449030_England_20200419_null_3)Node696,(epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1,(epi_isl_439409_England_20200331_null_1,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2)Node682,(epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2,epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1)Node686,epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_10)Node680,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1,(epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1,epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16)Node692,epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4,epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1,epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18,epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1,epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3,epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1,epi_isl_442625_England_20200405_null_2,(epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14)Node704,epi_isl_450454_California_20200325_null_18,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1,epi_isl_443744_England_20200325_null_1,(epi_isl_418703_England_20200317_null_1,epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1)Node747,(epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1,epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2)Node750,(epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1,epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3)Node754,(epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2,epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4)Node757,((epi_isl_440816_England_20200403_null_1,epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18)Node767,epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1)Node766,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1,epi_isl_444077_California_20200430_null_3,(epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6,epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5)Node774,((epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1,epi_isl_450472_California_20200404_null_4)Node778,epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1)Node777,epi_isl_444080_England_20200404_null_7,(epi_isl_423216_England_20200325_null_1,epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2)Node785,((epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3,epi_isl_442216_England_20200407_null_6)Node789,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1)Node788,epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1,(epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6,epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6,epi_isl_440521_England_20200304_null_5)Node795,epi_isl_435612_California_20200307_null_1,epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3,epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1,epi_isl_449684_England_20200415_null_1,epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1,epi_isl_445096_California_20200313_null_1,epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1,epi_isl_433959_England_20200411_null_1,epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2,epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,(epi_isl_440988_England_20200331_null_2,epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2)Node804,epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2,(epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1,epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2)Node809,epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2,(epi_isl_441250_England_20200401_null_2,epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2)Node814,epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5,(epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1,epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2)Node819,epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4,(epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10,epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1)Node824,epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1)Node829,epi_isl_420198_England_20200328_null_1,(epi_isl_448426_England_20200429_null_12,epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1)Node834,epi_isl_421787_England_20200326_null_1,epi_isl_442149_England_20200407_null_1,epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_442012_England_20200324_null_2,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1,epi_isl_440052_England_20200322_null_1,epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_442224_England_20200406_null_2,epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6,epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2,epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1,epi_isl_443478_England_20200414_null_5,(epi_isl_433051_England_20200404_null_3,epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3)Node13,epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_445174_California_20200331_null_1,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_452165_Utah_20200416_null_28185,(epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3,epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1)Node28,epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1,epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1,epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1,(epi_isl_429814_NS_20200315_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1)Node95,epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1,epi_isl_441573_England_20200404_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node110":"test",
"Node13":"test",
"Node185":"test",
"Node186":"test",
"Node187":"test",
"Node194":"test",
"Node197":"test",
"Node205":"test",
"Node208":"test",
"Node218":"test",
"Node219":"test",
"Node227":"test",
"Node231":"test",
"Node236":"test",
"Node241":"test",
"Node242":"test",
"Node249":"test",
"Node250":"test",
"Node254":"test",
"Node255":"test",
"Node265":"test",
"Node268":"test",
"Node274":"test",
"Node275":"test",
"Node276":"test",
"Node277":"test",
"Node28":"test",
"Node283":"test",
"Node287":"test",
"Node292":"test",
"Node293":"test",
"Node297":"test",
"Node302":"test",
"Node310":"test",
"Node314":"test",
"Node318":"test",
"Node320":"test",
"Node321":"test",
"Node327":"test",
"Node331":"test",
"Node334":"test",
"Node337":"test",
"Node338":"test",
"Node339":"test",
"Node369":"test",
"Node374":"test",
"Node375":"test",
"Node385":"test",
"Node389":"test",
"Node390":"test",
"Node394":"test",
"Node395":"test",
"Node413":"test",
"Node414":"test",
"Node420":"test",
"Node423":"test",
"Node426":"test",
"Node431":"test",
"Node432":"test",
"Node436":"test",
"Node437":"test",
"Node441":"test",
"Node442":"test",
"Node448":"test",
"Node451":"test",
"Node455":"test",
"Node456":"test",
"Node465":"test",
"Node472":"test",
"Node473":"test",
"Node477":"test",
"Node478":"test",
"Node482":"test",
"Node487":"test",
"Node493":"test",
"Node515":"test",
"Node526":"test",
"Node527":"test",
"Node533":"test",
"Node534":"test",
"Node539":"test",
"Node540":"test",
"Node544":"test",
"Node555":"test",
"Node562":"test",
"Node565":"test",
"Node580":"test",
"Node581":"test",
"Node586":"test",
"Node591":"test",
"Node596":"test",
"Node607":"test",
"Node611":"test",
"Node614":"test",
"Node617":"test",
"Node618":"test",
"Node624":"test",
"Node625":"test",
"Node631":"test",
"Node641":"test",
"Node644":"test",
"Node680":"test",
"Node682":"test",
"Node686":"test",
"Node692":"test",
"Node696":"test",
"Node699":"test",
"Node704":"test",
"Node709":"test",
"Node710":"test",
"Node714":"test",
"Node715":"test",
"Node719":"test",
"Node722":"test",
"Node725":"test",
"Node728":"test",
"Node731":"test",
"Node734":"test",
"Node737":"test",
"Node740":"test",
"Node743":"test",
"Node747":"test",
"Node750":"test",
"Node754":"test",
"Node757":"test",
"Node760":"test",
"Node766":"test",
"Node767":"test",
"Node774":"test",
"Node777":"test",
"Node778":"test",
"Node785":"test",
"Node788":"test",
"Node789":"test",
"Node795":"test",
"Node804":"test",
"Node809":"test",
"Node814":"test",
"Node819":"test",
"Node824":"test",
"Node829":"test",
"Node834":"test",
"Node95":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"background",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"background",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":"background",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":"background",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418676_England_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420679_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420760_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":"background",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":"background",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":"background",
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6":"background",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":"background",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4":"background",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":"background",
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_433959_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435612_California_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51":"background",
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":"background",
"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13":"background",
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7":"background",
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16":"background",
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14":"background",
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_438422_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_438615_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"background",
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_440007_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_440521_England_20200304_null_5":"background",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440988_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441318_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441625_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441875_England_20200429_null_6":"background",
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442078_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_442107_England_20200405_null_6":"background",
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442216_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442344_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442982_England_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443478_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_443648_England_20200416_null_9":"background",
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443766_England_20200328_null_7":"background",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443875_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444077_California_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_444368_England_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444418_England_20200419_null_17":"background",
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":"background",
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14":"background",
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13":"background",
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9":"background",
"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5":"background",
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16":"background",
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10":"background",
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_447936_England_20200428_null_26":"background",
"epi_isl_448097_England_20200506_null_4":"background",
"epi_isl_448100_England_20200508_null_16":"background",
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10":"background",
"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_448426_England_20200429_null_12":"background",
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":"background",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448819_England_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_448906_England_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3":"background",
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":"background",
"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26":"background",
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19":"background",
"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18":"background",
"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6":"background",
"epi_isl_449579_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_449605_England_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_449658_England_20200411_null_11":"background",
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18":"background",
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":"background",
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450234_California_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48":"background",
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_450454_California_20200325_null_18":"background",
"epi_isl_450472_California_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6":"background",
"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21":"background",
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5":"background",
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20":"background",
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13":"background",
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":"background",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2":"background",
"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15":"background",
"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12":"background",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66":"background",
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_32":"background",
"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_10":"background",
"epi_isl_451967_Moscow_20200321_null_22":"background",
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":"background",
"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_257":"background",
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_73":"background",
"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_242":"background",
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_232":"background",
"epi_isl_452141_Mexico_20200311_null_505":"background",
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":"background",
"epi_isl_452165_Utah_20200416_null_28185":"background",
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":23
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":7
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":31
}
}
}